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マイクロアレイ用の細胞サンプルについて
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No.5662-TOPIC - 2017/01/09 (月) 19:54:17 -
初心者
いつもお世話になっております。
マイクロアレイ解析を行う予定です。
ヒト細胞をペレットにして液体窒素で瞬間凍結したサンプルを提出する予定でした。ところが受託業者の方からRNA保存試薬で保存したサンプルの使用を推奨されました。この場合、凍結した細胞を一度融解してRNA保存試薬で処理後に再凍結して提出するのが良いのでしょうか。それとも、凍結状態のまま送付して解析して頂けるか、業者に相談すべきでしょうか。同一検体を取り直すのが困難であり、ご意見を伺えればと存じます。
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No.5662-4 - 2017/01/10 (火) 10:43:12 -
初心者
ご回答有難うございました。参考にさせていただきます。
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No.5662-3 - 2017/01/10 (火) 10:29:21 - mon
詳しくは業者に聞くとして
細胞融解時にRNAの劣化が起きますので、凍結細胞がペレットになっていて余分な液がないなら、凍結状態にRNA保存試薬を直接いれた方が良いです。
RNA保存試薬がRNAlaterなら急速な脱水・タンパク凝固で、TriSolのような溶液なら急速なタンパク変性で分解を防ぐことができます。
(無題)
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No.5662-2 - 2017/01/09 (月) 20:49:05 - AP
そりゃ輸送中あるいは業者に到着した後の事故の可能性を嫌うからでしょう。
保存するには凍結でいいでしょうけど、輸送中の温度管理は保証がないですから。
RNA保存剤で再処理して適切な温度で(必ずしも凍結しなければならないわけじゃないはずですけど)送付した方がいいと思います。
もし解析がうまくいかなかったときに、お客様がサンプルを適切に送ってくれなかったからです、って言われないようにも。
マイクロアレイ用の細胞サンプルについて
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No.5662-1 - 2017/01/09 (月) 19:54:17 -
初心者
いつもお世話になっております。
マイクロアレイ解析を行う予定です。
ヒト細胞をペレットにして液体窒素で瞬間凍結したサンプルを提出する予定でした。ところが受託業者の方からRNA保存試薬で保存したサンプルの使用を推奨されました。この場合、凍結した細胞を一度融解してRNA保存試薬で処理後に再凍結して提出するのが良いのでしょうか。それとも、凍結状態のまま送付して解析して頂けるか、業者に相談すべきでしょうか。同一検体を取り直すのが困難であり、ご意見を伺えればと存じます。
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