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(無題) 削除/引用 No.5277-8 - 2016/07/30 (土) 11:04:18 - AP これ http://www.orthodb.org/ とか、 これ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/homologene とか、 下ごしらえ済のデータベース

(無題) 削除/引用 No.5277-7 - 2016/07/29 (金) 17:09:06 - ANO Blastで、Organismの箇所で、種、あるいはTaxidで指定して アミノ酸配列なりcDNA配列なりかければよいはずです。

(無題) 削除/引用 No.5277-6 - 2016/07/27 (水) 23:31:20 - おお >人やマウスの遺伝子のページにいって、オーソログのリストを見ることができます。 ブラストしてあるカテゴリーに落ちるものをリスト化しているのだと思います。

(無題) 削除/引用 No.5277-5 - 2016/07/27 (水) 22:45:28 - Gen おおさん ありがとうございます。名前は聞いたことありましたしアクセスもしたことあったはずですが、なぜか頭に入っていませんでした。使いやすすぎますね。 BLASTで出てこなかった気になる種は、こちらで逐一調べてみようと思います。 これでしたいことが完璧に出来るようになりました。聞いてよかったです。どうもありがとうございました！

(無題) 削除/引用 No.5277-4 - 2016/07/27 (水) 13:15:40 - おお http://www.ensembl.org/info/about/species.html ここが使いやすいのではないかと。

(無題) 削除/引用 No.5277-3 - 2016/07/27 (水) 13:06:10 - Gen seventhさん ありがとうございます…。…あぁ、こんな単純なことも思い浮かばないなんて、我ながら情けないを通り越して無能さに絶望しました…。 素晴らしい案ですね。さっそくBLASTにかけて、大量に引っかかったのを順に除外リストに入れて、沢山配列をゲットしようと思います。アドバイス本当にありがとうございました！

(無題) 削除/引用 No.5277-2 - 2016/07/27 (水) 12:25:44 - seventh アミノ酸配列なりcDNA配列なりを持ってきてblastにでもかければいいのでは？

マイナーな生物の遺伝子・DNA配列の検索 削除/引用 No.5277-1 - 2016/07/27 (水) 10:09:18 - Gen マイナーと言ってもそこまでマイナーではなく、ヒトやマウス以外のほ乳類、例えばラビットやゴートや…サルとか、とにかくもの凄くよく研究に使われているわけではない生物の、興味ある遺伝子のホモログ的な分子の配列を調べたいと思っています。 NCBIのGeneで、ラビットの学名と遺伝子の一般名や対応するヒトの遺伝子名を入れてみたのですが、ヒットしませんでした。 ほ乳類のゲノムデータベース的なもので使えそうなものをご存知の方がいらっしゃいましたらご教示いただけると幸いです。

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