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(無題) 削除/引用 No.5195-2 - 2016/06/28 (火) 17:01:20 - たていす >細胞の検出と番号付は、元々RGB画像を8bit化し、Thresholdを行った後、 >Analyze particleを実行することで、可能でした。 とのことですから、 Analyze particleのところで、「Add to managerにチェックを入れて、」実行します。ROI managerが開き、選択された細胞輪郭情報が保存されています。 thresholdする前の元絵を再度表示して、ROI-managerで全ての輪郭情報を選択し、measureを実行します。 元画像のoverlayに細胞番号がふられていない時は。roi-managerのlabelかshow-allにチェックを入れると表示されるだろうと思います。 得られた結果をcsvフォーマットで保存して、エクセルなんかで解析するのでしょう。

imageJで検出した細胞の蛍光強度を一覧表にするには 削除/引用 No.5195-1 - 2016/06/28 (火) 12:57:43 - 初心者 ご覧いただきありがとうございます。 imageJで以下のことがしたいのですが、やり方がわかりません。どなたか、詳しい方が居たら、ご教授願えますでしょうか？ 細胞を検出する ↓ 細胞に番号付をする ↓ 細胞ごとの蛍光量（max, min, mean, s.d., med?）を一覧表にまとめる ↓ 自家蛍光量の低い順に並べる 細胞の検出と番号付は、元々RGB画像を8bit化し、Thresholdを行った後、Analyze particleを実行することで、可能でした。しかし、この操作で検出できた細胞枠と番号を、元の画像と照らし合わせ、元の画像の細胞ごとの蛍光強度を一覧表にまとめることが出来ませんでした。 元の画像に対し、手動で細胞の輪郭をなぞり、一つずつ蛍光強度を出していくのではなく、自動的に全ての細胞の蛍光強度を一覧表にしたいです。 何卒、お知恵を貸していただけますでしょうか？ よろしくお願いします。

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