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(無題) 削除/引用 No.4999-16 - 2016/04/20 (水) 23:03:57 - おお >どのプライマーの結果を採用するかは、 実験によります。増幅されたものはシーケンスしましたか？ 場合によっては、両方の結果を示して考察することもあると思います。特にRT-qPCRであれば、まずはデーターベースなどで増幅される可能性があるものをリストアップすることです。場合によっては逆の鎖からもRNAが合成されているかもしれません。

プライマーの設定場所 削除/引用 No.4999-15 - 2016/04/20 (水) 19:28:26 - mimi 横ヤリすいません。 リアルタイムPCRで、プライマーの作成場所によって得られる結果が異なる場合、どのプライマーの結果を採用するかは、 どのように決めたら良いのでしょうか？ よろしくおねがいします。

(無題) 削除/引用 No.4999-14 - 2016/04/19 (火) 11:01:23 - おお あとプライマー配列が示されてなくて不安なのは、その遺伝子を見ているとしても、正確に何を見ているのかイマイチ把握できてないところです。マイナーなスプライシングアイソフォームとかデーターベースにないようなものも可能性としてあったりするわけで、、、

(無題) 削除/引用 No.4999-13 - 2016/04/19 (火) 10:55:30 - おお びっくりぽんや

(無題) 削除/引用 No.4999-12 - 2016/04/19 (火) 10:05:14 - WoW すごくカルチャーショックを受けた経験があるんですが、とある分野では、配列非公知のプライマーセットを用いた検査系のキットについて、そのPCR産物の配列を読んだ上で、このキットではこういうプライマー配列、こちらのキットではこういう配列を使っているようですよ、ということを調べあげて、増幅効率などと併せて新たな論文として発表するということが普通に行われていました。 そんなもんでペーパーになるのか、とびっくりしました。

(無題) 削除/引用 No.4999-11 - 2016/04/19 (火) 09:42:12 - おお 教えたくないにしてもIDを開示しているわけだから、このプライマーで実験できるよって言っているようなもので、直接配列が見れなくても、マテリアルには透明性があるので、配列教えているようなもんですよね。 でも確かに配列がわからないでプライマー買うのはちょっと抵抗があります。実験次第かもしれませんけど、自分で設計しちゃうかな。。。

(無題) 削除/引用 No.4999-10 - 2016/04/19 (火) 08:52:43 - prime 論文で使われているプライマーでも上手く行かないことって結構ありますよね。 結局、自分で設計しなおした方がよいことがままあります。 企業で売っているプライマーはちゃんと増えることを保証している場合が多く、そのための確認試験をしているはずなので、無償では情報を開示しないでしょう。 買った側もそれを理解していれば、論文で公開しません。 せっかく金だしたのに他人に教えたくないとかケチな理由ではなく、企業への最低限のマナーだと思います。

(無題) 削除/引用 No.4999-9 - 2016/04/19 (火) 00:47:22 - しろ 配列の検索は、データーベースの利用もありかと思います。 PrimerBank https://pga.mgh.harvard.edu/primerbank/ 配列を検索にかければそれを使っている論文もヒットして確認できるかと思います。探せば他にもデーターベースはあるかと思いますが、まぁハーバードだから大丈夫かな、と。頑張って。

(無題) 削除/引用 No.4999-8 - 2016/04/18 (月) 13:30:05 - a そういうものなのですね…。 皆様回答ありがとうございました。 私の研究室では配列の検討をせずにいきなり買うというのは難しそうなので、配列を公開している論文を探すことにします。 とても参考になりました。 ありがとうございました。

(無題) 削除/引用 No.4999-7 - 2016/04/18 (月) 13:06:14 - おお 公開したくなかったのか、公開するものではないと思ったのか、タカラは論文での公開についてどういう利用規約をつけているのでしょうか。。。なんにもそのへんは触れてないのかな。

(無題) 削除/引用 No.4999-6 - 2016/04/18 (月) 12:55:48 - alpha Takaraは購入するまで配列がわかりませんよね。 購入すると、プライマーと一緒にその配列も教えてもらえます。 その論文では公開したくなかったのでしょう。 お金を払ったのに、真似されたくなかったのだと思いますよ。

(無題) 削除/引用 No.4999-5 - 2016/04/18 (月) 12:12:58 - おお TAKARAは知りませんけど、購入したときに配列がわかるようになっている会社もありますね。

(無題) 削除/引用 No.4999-4 - 2016/04/18 (月) 12:06:24 - AA Taqmanのプローブなどもそうですが、市販のオリゴDNAを配列だけ調べて 合成サービスで安く買うのは不可能だと思います。 該当するサービスの製品を購入するしか無いですし、 たぶん買っても配列は不明のままだと思います。

(無題) 削除/引用 No.4999-3 - 2016/04/18 (月) 11:42:34 - おお だからそれを買えばいいんじゃないの？

(無題) 削除/引用 No.4999-2 - 2016/04/18 (月) 11:23:40 - ん んなん分かるわけないやん笑 注文前に配列知られたら商売ならへんやろまいやw

論文を参考にPCRのプライマーを注文したいのですが 削除/引用 No.4999-1 - 2016/04/18 (月) 11:01:46 - a real-time　PCRを行っています。 新たにprimerを注文したくて検索しているのですが、論文を参考にprimerを注文することになりました。 しかし、IDが載っているのみでプライマーの配列がわかりません。 たとえば Akt1:TakaraのPrimer Set ID HA169699 takaraのホームページにログインしてIDを検索しても、注文ページは出るのですが、肝心のprimer配列が見当たりません。 注文すれば情報がわかるようなのですが、注文前に配列がわかるような検索の仕方やサイトなどどなたかご存知ないでしょうか？ よろしくお願いします

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