Bio Technical フォーラム

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コンストラクション トピック削除
No.497-TOPIC - 2012/05/09 (水) 12:04:47 - 駆け出し初心者
私は今年で大学4年生になり、卒研を始めました。今はコンストラクションをやっていますが、ミニプレップしたプラスミドDNAのペレットを溶かす際、今まではピペッティングで溶かしていましたが、ボルテックスで溶かしても大丈夫ですか?ボルテックスの激しい振動により、プラスミドDNAは壊れたりしませんか?
 
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(無題) 削除/引用
No.497-5 - 2012/05/10 (木) 12:05:30 - Q
何でもネットで解決するなよ・・・

すぐそばに居るリアルな人に聞こうよ・・・。

アドバイス感謝します 削除/引用
No.497-4 - 2012/05/09 (水) 13:58:25 - 駆け出し初心者
確かに教わったことに従わないことは良くないことだと思います。うちの研究室はそこまで実験方法に厳しくないので、プラスミドDNAさえ溶かせば、自分なりの方法でやってもよいという雰囲気です。アドバイスありがとうございました。

(無題) 削除/引用
No.497-3 - 2012/05/09 (水) 13:55:16 - AP
サイズがあまり大きくないDNAならvortexしても構いません(実害が無いレベル)。おおよその目安は10 kb以下、cccのプラスミドならもう少し大きくてもいいかもしれません。

cccのプラスミドの場合、nickやdouble strandbreakが生じるとcccに対するOCやlinearの比率が上がるので電気泳動すればすぐに分かります。一度、vortexありとなし(あるいはピペッティング)で比べてみたらどうでしょうか。

vortexを避けてpipettingにするメリットはあまり感じません。large boarのチップを使うなど配慮しなければ、剪断力はかなり強いです。多サンプルだとチップをいちいち替えなきゃならなかったりして面倒だし。vortexよりマイルドな攪拌方法としてtappingというテクニックもよく使われますけど?

大丈夫の評価基準は? 削除/引用
No.497-2 - 2012/05/09 (水) 13:18:04 - ~
>ボルテックスの激しい振動により、プラスミドDNAは壊れたりしませんか?
せん断力が働くため、絶対に壊れないとはいえません。
ただ、ピペッティングでもせん断力自体は生じますし、
その操作で次の実験に影響を与える怖れはほとんど無いと思います。

>ボルテックスで溶かしても大丈夫ですか?
サンプル自体や、そのサンプルを使用した次の実験の結果への影響についてはおそらく大丈夫でしょう。

ただ、ピペッティングの操作はあなた自身が本で調べたのでしょうか?
ラボ内で教員や先輩に教わっていたのであれば、あなた自身の評価が、「指示したことを守らず、勝手なことをする人」にランクダウンする可能性があります。
その場合、今後の指導や推薦書の内容等に影響する可能性が生じるため、大丈夫とはいえないでしょう。

コンストラクション 削除/引用
No.497-1 - 2012/05/09 (水) 12:04:47 - 駆け出し初心者
私は今年で大学4年生になり、卒研を始めました。今はコンストラクションをやっていますが、ミニプレップしたプラスミドDNAのペレットを溶かす際、今まではピペッティングで溶かしていましたが、ボルテックスで溶かしても大丈夫ですか?ボルテックスの激しい振動により、プラスミドDNAは壊れたりしませんか?

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