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SNPのupstream-variantとdownstream-variantとはなんですか トピック削除
No.4886-TOPIC - 2016/02/29 (月) 21:16:46 - かつよ
こんばんは。いつも勉強させて頂いております。
SNP登録内容の、upstream-variantとdownstream-variantについて質問させて下さい。

downstream-variantとupstream-variantはどのような意味なのでしょうか?
5' → 3’の配列で登録されたSNPがdownstream-variantで、
3’→ 5’の配列で登録されたSNPがupstream-variantという意味でしょうか…。

同定したバリアントが新規のバリアントなのか、
既に登録されているSNPなのかを判断するにあたり困っています。
ご教授の程、よろしくお願い致します。
 
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(無題) 削除/引用
No.4886-2 - 2016/03/02 (水) 07:25:18 - eff
http://www.sequenceontology.org/browser/current_svn/term/SO:0001631
http://www.sequenceontology.org/browser/current_svn/term/SO:0001632

SNPのupstream-variantとdownstream-variantとはなんですか 削除/引用
No.4886-1 - 2016/02/29 (月) 21:16:46 - かつよ
こんばんは。いつも勉強させて頂いております。
SNP登録内容の、upstream-variantとdownstream-variantについて質問させて下さい。

downstream-variantとupstream-variantはどのような意味なのでしょうか?
5' → 3’の配列で登録されたSNPがdownstream-variantで、
3’→ 5’の配列で登録されたSNPがupstream-variantという意味でしょうか…。

同定したバリアントが新規のバリアントなのか、
既に登録されているSNPなのかを判断するにあたり困っています。
ご教授の程、よろしくお願い致します。

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