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(無題) 削除/引用 No.4854-7 - 2016/02/17 (水) 18:45:10 - 中年 RNAをphotoaffinity labelingするのも有効かもしれません。 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20946768

(無題) 削除/引用 No.4854-5 - 2016/02/17 (水) 18:00:42 - ふみ 1次構造上で離れた場所であるけれど3次構造形成後に近接する2箇所の塩基でFRETを利用して立体構造形成を評価できたりしないでしょうか。

(無題) 削除/引用 No.4854-4 - 2016/02/17 (水) 17:46:46 - P おおさん RNaseAは一本鎖RNA特異的に働くのですね。それならばフットプリントで証明することも可能かもしれません。ありがとうございます。 わわさん ＞Pさんが想定している高次構造とういのはどの程度のものなんでしょうか？ 三次構造の形成、またはその構造の安定化に働いていることを考えております。

(無題) 削除/引用 No.4854-3 - 2016/02/17 (水) 16:56:45 - わわ Pさんが想定している高次構造とういのはどの程度のものなんでしょうか？ ステムループ程度の二次構造なのか，もう少し高次のはなしなのか教えて頂きたいです．

(無題) 削除/引用 No.4854-2 - 2016/02/17 (水) 15:34:07 - おお 高次構造がヘリックスなど２本鎖になっている場所があるという想定ならRNase処理で一本鎖部分を切ることもできるんじゃないかな。たしかRNaseAなんかも一本鎖の部分がターゲットになっていたはずだし。そういう視点でフットプリントを使ってるのではないでしょうか。

RNAフォールディングに働くと考えられるタンパク質の機能の証明 削除/引用 No.4854-1 - 2016/02/17 (水) 15:07:13 - P 初めて利用します。よろしくお願いします。 現在あるタンパク質の機能を調べています。 このタンパク質が、RNAの高次構造の形成に働いている可能性を検証したいのですが、 どのように調べたらいいかわかりません。 EMSAでRNA結合活性があることは確認しています。 フットプリント法によって、「フォールディングに関与している」と結論している報告 があるのですが、これだと結合は示せても、その機能がRNAのフォールディングに働いているかどうかはわかりませんよね？ どなたか、ご教授いただけませんでしょうか？

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