Bio Technical フォーラム

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転写活性化 トピック削除
No.4790-TOPIC - 2016/01/28 (木) 19:02:59 - 無知
ある植物の系統間でマイクロアレイ解析をしました。
片一方の系統で転写(全体)が活性化しているというにはどのような遺伝子の発現量が指標となりますか?
RNAポリメラーゼIIとかの発現量が指標とかになりますでしょうか?
 
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(無題) 削除/引用
No.4790-4 - 2016/01/31 (日) 17:26:59 - あああ
EU (5-Ethynyl Uridine)
とかはどうですか?

(無題) 削除/引用
No.4790-3 - 2016/01/29 (金) 00:33:29 - おお
ヒト培養老化細胞で、多分リポソームとか(たぶんRNAポリメラーゼとかもだったとおもう)が減っているという話があった。どのようにして調べたんだろうとおもってはいたが、それはそのときには突っ込んで調べなかった。マイクロアレーができる以前のレビューでしたが、何を指標にしたかなど見てみると参考になるかと。

リボソームの量はマイクロアレーでは無理っぽいし、Standardizeはグローバルなシグナルで合わせているだろうから、全体が落ちていたらそういう変動はみれない。結構厳しいのでは?
何か取り込み実験とかしたほうがいいかとおもいます。

(無題) 削除/引用
No.4790-2 - 2016/01/28 (木) 22:52:51 - ふみ
DNAとRNAを失わないような核酸試料調整を改めてし直して、植物体湿重量あたりのRNA含量ならびにDNA重量あたりのRNA量を系統間で比べてみては如何?

転写活性化 削除/引用
No.4790-1 - 2016/01/28 (木) 19:02:59 - 無知
ある植物の系統間でマイクロアレイ解析をしました。
片一方の系統で転写(全体)が活性化しているというにはどのような遺伝子の発現量が指標となりますか?
RNAポリメラーゼIIとかの発現量が指標とかになりますでしょうか?

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