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N型糖鎖の論文の解釈 トピック削除
No.4631-TOPIC - 2015/12/02 (水) 15:52:46 - Nglycan
N型糖鎖の質量分析に関する論文を読んでいますが、理解に苦しんでいます・・

質量m/z 204はヘキソサミン、m/z 162はヘキソースというのはわかるのですが、哺乳細胞の糖タンパク質をPNGaseF処理してpermethylationしたものの質量分析では、例えばN型糖鎖のhigh mannose (Man5)や Man9の質量が論文ごとで異なるのはなぜなんでしょうか?

たとえば、GlcNAc-GlcNAc-(Mannose)5やGlcNAc-GlcNAc-(Mannose)9のそれぞれのMSピークの質量が、同じ糖鎖構造にも関わらず論文によって分子量が異なります。これはどうしてでしょうか?
 
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(無題) 削除/引用
No.4631-4 - 2015/12/09 (水) 17:43:03 - mbb
糖分析には詳しくないのですが、
付加イオンの影響とは違うので
しょうか?

(無題) 削除/引用
No.4631-3 - 2015/12/09 (水) 13:26:13 - みみみ
硫酸化などの修飾が原因では?

(無題) 削除/引用
No.4631-2 - 2015/12/02 (水) 16:01:34 - おお
答えられるかどうかわかりませんが、興味がありますので差し支えなければその両者の論文を提示していただけませんか?

N型糖鎖の論文の解釈 削除/引用
No.4631-1 - 2015/12/02 (水) 15:52:46 - Nglycan
N型糖鎖の質量分析に関する論文を読んでいますが、理解に苦しんでいます・・

質量m/z 204はヘキソサミン、m/z 162はヘキソースというのはわかるのですが、哺乳細胞の糖タンパク質をPNGaseF処理してpermethylationしたものの質量分析では、例えばN型糖鎖のhigh mannose (Man5)や Man9の質量が論文ごとで異なるのはなぜなんでしょうか?

たとえば、GlcNAc-GlcNAc-(Mannose)5やGlcNAc-GlcNAc-(Mannose)9のそれぞれのMSピークの質量が、同じ糖鎖構造にも関わらず論文によって分子量が異なります。これはどうしてでしょうか?

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