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RNaseの作用点について トピック削除
No.4587-TOPIC - 2015/11/13 (金) 10:13:24 - volcano
１）1本鎖RNAに対して、哺乳類（ヒト）のRNaseはどのように作用して、分解しているのですか？もしEndonucleaseならRNAのどの部分が作用点になっているのでしょうか？

２）またRNaseは、miRNAに対しては、どこを標的にしているのでしょう？

３）またRNaseは、dsRNAに対しては、どこを標的として分解するのでしょうか？

４）その根拠になりそうな論文や参考書はございますか？

以上、最近どうしても知りたいのにわからないことをお伺いいたします。

お知恵をお貸しください。よろしくお願い申し上げます。
　
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(無題) 削除/引用
No.4587-5 - 2015/11/24 (火) 00:45:35 - ＿
そもそも人のRNaseって全部わかっているんでしょうかね？
質問内容がすべて出ているreviewがあればぜひ読んでみたいものです...

(無題) 削除/引用
No.4587-4 - 2015/11/13 (金) 11:01:15 - おお
RNase AやRNase Tはsingle strand RNAをきるといわれています。塩基特性がいくらかあって3´ of pyrimidineとRNaseAはここに書いています。
ttps://www.promega.com/products/biochemicals-and-labware/biochemical-buffers-and-reagents/rnase-a-solution/

RNsae Tはcleaves the phosphodiester bond between the 3'-guanylic residue とここにかいてます。
ttps://www.thermofisher.com/order/catalog/product/EN0541

RNase Iは塩基による特異性はないはず。

RNaseHはDNAにhybridizeしたRNAが標的。

RNase IIIはdouble strand RNAが標的で、最終てきには20bpぐらいのdouble strand RNAができる。
ttps://www.neb.com/products/m0245-shortcut-rnase-iii

DNAだけでなくRNAもけずるexonucleaseもありますし。mRNAのpoly Aを削る3'-5' exonucleaseやcap構造が外されたmRNAを5'から削る5'-3' enxonucleaseも生化学的な実験で調べられています。

molecular cloningの3rd Edだとたしかapendexに酵素の特性がまとまってたはず。一番新しいのはどこに書いているかまだ確認してません。

またmolecular biologyの酵素を扱っている各社の特に紙のカタログにはまとめてあったりすることがあるので調べてみればいいでしょう。そうでなくても上記のように各商品の説明に酵素の特性がまとめてあります。たいていそれのreferenceにたどり着けるようにもなっていると思います。

(無題) 削除/引用
No.4587-3 - 2015/11/13 (金) 10:42:40 - AP
リボースの2' OHがリン酸ジエステル結合を求核攻撃するのを促進するんじゃないですか。
RNAの自発的な分解や、二価金属イオンで触媒される分解もそうだったはず。

(無題) 削除/引用
No.4587-2 - 2015/11/13 (金) 10:29:31 - 独り言
RNAseっていわれてもいろいろあるし。

https://ja.wikipedia.org/wiki/%E3%83%AA%E3%83%9C%E3%83%8C%E3%82%AF%E3%83%AC%E3%82%A2%E3%83%BC%E3%82%BC

RNaseの作用点について 削除/引用
No.4587-1 - 2015/11/13 (金) 10:13:24 - volcano
１）1本鎖RNAに対して、哺乳類（ヒト）のRNaseはどのように作用して、分解しているのですか？もしEndonucleaseならRNAのどの部分が作用点になっているのでしょうか？

２）またRNaseは、miRNAに対しては、どこを標的にしているのでしょう？

３）またRNaseは、dsRNAに対しては、どこを標的として分解するのでしょうか？

４）その根拠になりそうな論文や参考書はございますか？

以上、最近どうしても知りたいのにわからないことをお伺いいたします。

お知恵をお貸しください。よろしくお願い申し上げます。
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