全2件 ( 1 〜 2 )　 前 | 次 　1/ 1. /1

(無題) 削除/引用 No.4571-2 - 2015/11/10 (火) 03:32:00 - おお 論文に記載された配列が間違っているかもしれません。まずはwhole genomeでblastをしてゲノム上にその配列があるか確認して、それでもないか、見当違いのところに出てくるようでしたら、著者にきいてみるといいかもしれません。 >またプロモーター上にどのようなモチーフがあるのか http://motifmap.ics.uci.edu/ いろいろあると思いますが上記のものはそう言ったファンクションがあります。もっと便利な、ソフトもあるかもしれませんのでほかの方の回答も得られるといいですね。

ChIPのためのプライマー設計とプロモーター検索 削除/引用 No.4571-1 - 2015/11/10 (火) 02:46:14 - 大学院生 ある転写因子がプロモーターに結合することを確認するため、目的プロモーターの配列を調べたいのですが、論文を引く以外にデータベース等の便利なものおすすめはありますでしょうか？DBTSSというサイトを使ってTSSの前後配列を入手し、論文報告のあるChIPプライマーとBLASTをかけたのですがヒットしないため、どうすれば良いか頭を悩ましています。 またプロモーター上にどのようなモチーフがあるのかも調べたいのですがネットで調べてもよくわからず困っています。 上記内容を含めChIP用プライマー設計方法を教えてください。 よろしくお願いしいます。

全2件 ( 1 〜 2 )　 前 | 次 　1/ 1. /1

パスワードを入力してチェックした記事を

チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する 名前  メール  　アドレス非公開    タイトル  本文       設定  クッキーを保存（次回の入力の手間を省けます） 上に上げない（トピックの一覧で一番上に移動させません） 解決（問題が解決した際にチェックしてください） 暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。 送信

---

〔使い方〕 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。

---