RAWデータで蛍光の増加は生じていますか?
蛍光が増えているのに、増幅曲線が描けていないなら、蛍光色素の指定を間違えているのでは。本来SYBRを、FAMやVICとかに。うまくいった時と値を比べてみてください。
どの色素も増幅していないなら、増えていないんでしょうね。
けど、PCR後のサンプルを電気泳動して、本当にPCR産物が生じていないか確認してみては?
ピークが複数ある、というのはメルティングカーブのところだと思うんですが、これは蛍光強度がまともに増加していないからノイズ程度の変化を拾っているだけかも。メルティングカーブの強度もうまくいった時と比べてみてください。
あと、温度変化の履歴を確認して、サイクルがきちんと進行していたか確認もするべきでは。 |
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