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(無題) 削除/引用 No.4561-6 - 2015/11/07 (土) 00:49:41 - おお たとえばどちらにしても、閾値を設定してそれ以上のものを遺伝子リストにした場合 DAVID Bioinformatics Resources (https://david.ncifcrf.gov/ )にリストをインプットすればGOやその他いろいろなもののenrichmentの具合を見ることはできると思います。見当違いだったらごめんなさい。 いまは発現量などの数字も加味して計算してくれるようになってるんですかね。

完全ではないですが 削除/引用 No.4561-5 - 2015/11/06 (金) 19:19:12 - ema 自分が使った範囲ですが（もっと世間には色々あるのは知っているのですが） �@発現強度の値 ですと有償ならNextBio、IPA（GeneSpringGXとの共利用だともっと便利） 無償は近年宣伝されているExAtlas 等が使いやすかったです。 �A遺伝子相互（結合）作用の強さの値 は、関連する遺伝子という情報（関連が深いと大文字そうでもないと小さい文字）でなら上記のソフトで出ると思いますが、 「結合作用の強さの値」、、、の入力って覚えてないから無いかも。

(無題) 削除/引用 No.4561-4 - 2015/11/06 (金) 17:43:44 - とらこ 抗生物質のとらこです。 なぜか初登場なのに、すでになりすましされてます。 抗生物質のNo.4560-3の投稿も（まともな返信ですが）、ここのNo.4561-2も別人のとらこさんです。 それとも過去にとらこさんがすでにいらしたのかしら。 トピ主さん、関係ないコメントでごめんなさい。

(無題) 削除/引用 No.4561-3 - 2015/11/06 (金) 17:15:21 - えー 抗生物質のとらこさんなら、最低ですね。

(無題) 削除/引用 No.4561-2 - 2015/11/06 (金) 16:40:26 - とらこ GGRKS

遺伝子発現データ、遺伝子相互作用の組み合わせ 削除/引用 No.4561-1 - 2015/11/06 (金) 15:50:15 - gene ある遺伝子群に対して �@発現強度の値 および �A遺伝子相互（結合）作用の強さの値 が分かっている場合 ここから有意な生物学的アノテーション（GOやKEGGなど）を出力するような プログラムはWEB上でありますでしょうか。 コマンド入力などせず、TXTファイルのアップロードで済むような プログラムですと助かります。

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