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定量生物学的なデータベース
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No.4517-TOPIC - 2015/10/23 (金) 11:52:23 -
新参者
いつも勉強させていただいています。
ヒト細胞内におけるある特定のタンパク質の分子数を知ることができるような
使いやすそうな公的に開示されたデータベースで,お薦めのものなどありましたらお教えいただけないでしょうか(組織や細胞種などが限定されていても構いません)。自分で検索しているのですが,上手く割り出すことができません。
よろしくお願いします。
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No.4517-8 - 2015/10/23 (金) 20:13:45 - 新参者
そうですね。サイトカインは私は経験はありませんが,
ステロイドホルモンはELISAで定量実験を行ったことがあります。
今回はその手のものではありませんが,今後留意します。
ご指摘どうもありがとうございます。
(無題)
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No.4517-7 - 2015/10/23 (金) 14:57:39 - おお
例えば血液中とか、細胞を培養した時の培地中のサイトカインなどの濃度であればELISAをつかって、絶対量でスタンダードをおくことは良くあるので分子数とか、絶対量を見積もることはできますね。
(無題)
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No.4517-6 - 2015/10/23 (金) 14:13:58 -
新参者
おおさん,コメントをいただきまして
ありがとうございます。
実は実験条件の至適化を目的とした細胞内タンパク質の
量的見積もりを検討しているうちにでてきたお伺いです。
本トピックを含め,今後もご教示いただけましたら幸です。
(無題)
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No.4517-5 - 2015/10/23 (金) 12:53:00 - おお
わたしも分子数ベースでとか何度か思ったことがあります。うーんでもデーターベースで網羅的にとなると、、、でも興味があるのでわたしもレスを楽しみにしてます。。。ごめんなさい回答でなくって。
(無題)
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No.4517-4 - 2015/10/23 (金) 12:41:14 - 新参者
たていすさん,早々にご解答ありがとうございます。
この分野にBGがないもので,少々困っていました。
さっそくpaxdb勉強させていただきます。
ありがとうございました。
(無題)
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No.4517-3 - 2015/10/23 (金) 12:21:57 - たていす
PAX-DBは、LC-MS2で求めた(?)protein abundanceのデータベースだと思います。
ヒト細胞内とは大風呂敷で、タンパクの分子数とは、また細かいですね。
定量生物学的なデータベース
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No.4517-1 - 2015/10/23 (金) 11:52:23 -
新参者
いつも勉強させていただいています。
ヒト細胞内におけるある特定のタンパク質の分子数を知ることができるような
使いやすそうな公的に開示されたデータベースで,お薦めのものなどありましたらお教えいただけないでしょうか(組織や細胞種などが限定されていても構いません)。自分で検索しているのですが,上手く割り出すことができません。
よろしくお願いします。
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