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マイクロサテライト多型から系統樹を作成する方法 削除/引用 No.4513-1 - 2015/10/21 (水) 11:25:35 - AA マイクロサテライト多型を解析して、系統樹を作成しようとしています。 塩基配列ではなく、複数ローカスにおけるそれぞれの型を並べたデータを用いて、Phylipで系統樹をかいています。 個体A、B、C、D、E、F、Gから、７つに分岐した系統樹はできたのですが、 ネズミA、ネズミB、イヌC、イヌD、ウサギE、ウサギF、ネコGのデータから、 ネズミ、イヌ、ウサギ、ネコの４つに分岐した系統樹の作成方法がわからず苦戦しています。 つまり、各動物種に複数の個体が含まれるデータから、種の系統樹をかく方法です。 種内でも多様性があり、あらかじめ平均値や最頻値をとったデータではなく「個体それぞれの型」を解析するかたちで系統樹にしたいのですが、どうすればいいでしょうか。

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