この度、初めて、ホモロジーモデリングというのをしてみたいと思っております。
具体的に言いますと、
とある反応を触媒するシトクロムP450タンパク質を新たに発見しました。
そのタンパク質が、
@リガンドとどのように結合するのか
A似たような反応を触媒するタンパク質と三次元構造は似ているのか
B鉄はどこの部分で配位しているのか
C重要なタンパク質はどの部分か
等を調べたいです。
簡単にですが、自分で調べたところ、かなり色々なツールが出てきて、どれが最も最適なのか、初心者に使いやすいのかが良く分かりません。
・おすすめを教えていただけますでしょうか。
・Aのように他のと比較する場合、他のものは三次元構造が分かっていないとやはり比較できないでしょうか。
ご教授のほど宜しくお願いします。 |
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