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cDNA合成について 削除/引用 No.4374-5 - 2015/08/29 (土) 10:48:18 - 伊右衛門 おお様 勉強不足を痛感しました。 このような質問に丁寧にメッセージを頂いて感謝です。 ＞まずはいろいろと考えるべきでしょう。 おお様のメッセージを参考にさせて頂き、勉強していろいろ考えます。 すみませんでした。 本当にありがとうございました。

cDNA合成について 削除/引用 No.4374-4 - 2015/08/29 (土) 10:35:47 - 伊右衛門 AP様 早速の御返答をありがとうございます。 肝心な所を把握しておらず、勉強不足のまま質問してしまいました。 出直してきます。 ありがとうございます。

(無題) 削除/引用 No.4374-3 - 2015/08/29 (土) 10:12:49 - おお もし、ウイルスがDNAウイルスならtrizolでRNAを抽出しなくてもDNAを抽出して感染しているかはかれるような気がします。DNAウイルスつかっていて感染してないウイルス粒子が除けないために細胞内で合成されたRNAを指標にしたいということであれば、ウイルスのDNAゲノムの除去は場合によっては必要かもしれません。RNAもスプライシングなどされるのならゲノムと区別がつくので、そう言う場合は必要がないかもしれません。 RNAウイルスならcDNAにしてPCRすればサンプルにそんざいするRNAウイルスとそれに伴い合成されるRNAの量がみれます。でその配列がその植物にあるの?そこを考えるべきだと思います。またウイルスによっては逆転写酵素などを介してゲノムDNAにintegrateされるものがあります。さてそうなるとどうでしょう。感染したかどうかの判定にはその様なゲノムからのシグナルを拾ってもいいのかもしれません。まずはいろいろと考えるべきでしょう。

(無題) 削除/引用 No.4374-2 - 2015/08/29 (土) 09:08:44 - AP 標的が植物ゲノム由来のRNAではなく、RNAウイルスであればDNase処理は意味ないですね。RNAウイルス、すなわちゲノムがRNAのウイルスですが、もしそうなら、そこを把握していなかったのは、問題あるなあ。

cDNA合成について 削除/引用 No.4374-1 - 2015/08/29 (土) 08:44:27 - 伊右衛門 大学4年生実験初めてです。 宜しくお願いします。 マメの植物体からトリゾルでＲＮＡを抽出して、 ウイルスの感染有無を確認する実験をしています。 ラボのボスから「DNase処理は不要」と指示されており、 抽出したＲＮＡをゲノム除去しないでそのままcDNA合成していますが、 これって大丈夫なんでしょうか？ cDNA合成の時に、ゲノムが合成されるんじゃ？といつも不安でいます。 それを訴えると「ウイルスだからゲノムは関係ない」と返答されますが・・・。 cDNAを合成する時は、ウイルスだろうがゲノム除去は必要ですよね？

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