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CRISPRのゲノム編集はdeletionだけですか？ トピック削除
No.4328-TOPIC - 2015/08/09 (日) 13:15:23 - くりす
今CRISPRである遺伝子をノックアウトした細胞を作成中です。
今は各クローンのgenotypingをしています。

ほとんどがdeletionだったりWTだったりするのですが、中には、3塩基が挿入したものがみつかりました。

CRISPRってindel mutationを引き起こすっていいますが、あらかじめDNAフラグメントを共発現しない限りは基本的にはdeletionなのでは？と思わずにいられません・・

結構insertion変異は認められますかね？
　
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(無題) 削除/引用
No.4328-3 - 2015/08/09 (日) 19:42:29 - AA
CRISPRによる変異って"InDel"って表記することが多いと思うのですが、
その辺をどう捉えていらっしゃるんでしょうか？

100bp近いインサートが入ることも多々あります。

(無題) 削除/引用
No.4328-2 - 2015/08/09 (日) 15:26:33 - おお
https://www.addgene.org/CRISPR/guide/
During NHEJ repair, InDels (insertions/deletions) may occur as a small number of nucleotides are either inserted or deleted at random at the DSB site.

CRISPRのゲノム編集はdeletionだけですか？ 削除/引用
No.4328-1 - 2015/08/09 (日) 13:15:23 - くりす
今CRISPRである遺伝子をノックアウトした細胞を作成中です。
今は各クローンのgenotypingをしています。

ほとんどがdeletionだったりWTだったりするのですが、中には、3塩基が挿入したものがみつかりました。

CRISPRってindel mutationを引き起こすっていいますが、あらかじめDNAフラグメントを共発現しない限りは基本的にはdeletionなのでは？と思わずにいられません・・

結構insertion変異は認められますかね？
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