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(無題) 削除/引用 No.4277-3 - 2015/07/26 (日) 15:38:47 - protein うーん、そんなに言い切るほど間違いなんでしょうかね。 そんなこと言ったらどんな条件だって比べられないと思いますが。 Arrayデータに同じ臓器があるなら、細胞数云々じゃなくて、 アレイ的な正規化（全プローブのシグナルの合計でノーマライズ）を行ったあとに変化が少なそうなハウスキーピング遺伝子を使うということで悪くないんじゃないですか。

(無題) 削除/引用 No.4277-2 - 2015/07/17 (金) 00:29:57 - おお 臓器といってもageや病態、sexやその他いろいろなバリエーションがあって、すべてにおいて臓器間比較Arrayと同様のプロファイルになると限らないとおもいます。 ただし、ご指摘のような試みはありまして、どの遺伝子をinternal controlにするとよさそうだという提案は論文で見たことがあります。 あとArrayのデーターで細胞数ベースの数字を出すのは無理があると思いますが。

qPCRでの臓器間比較 削除/引用 No.4277-1 - 2015/07/16 (木) 19:20:11 - た qPCRでの臓器間比較は、教科書的には間違えということになっています。 （Referenceが臓器間で同量発現しているという証拠がないため） でも正直、GEOとかにある臓器間比較Arrayデータから、 全遺伝子量≒使用した細胞数で補正したデータを得て その中で臓器間で変化のないGeneリストを取ってくれば いいだけのような気もするのですが、そこのとこどうなのでしょう？

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