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Elisa用タンパク抽出液(自作) トピック削除
No.4259-TOPIC - 2015/07/11 (土) 06:43:38 - 小児科医師(ゆとり教育)
いつもお世話になっております。

培養細胞(SH-SY5Y)からタンパクを抽出し、Elisa、ウェスタンブロットを行う実験を新たに始めるところです。タンパク抽出液にInvitrogen FNN0011を検討していたのですが、組成が公開されており買うのももったいないと思って自作しようとしたら、EGTA、NaF、Na4P2O7、Na3VO4といろいろと試薬がありませんでした。

細胞は実験を始めないといけない状態になっており、上記の試薬が研究室にないことが判明したのが金曜日の18時で、周りの研究室(複数)に聞いて回ったのですがいずれも持っていませんでした(平日は臨床や講義で試薬を調べる時間がありませんでした)。卸業者に至急、FNN0011を持ってきてもらおうとしたのですが在庫を持っていないそうで無理でした。

日曜日にはタンパクを回収しないといけないので、他のプロトコールを探していてAbcamのELISA sample preparation guideをみつけました。

ELISA sample preparation guide
ttp://www.abcam.co.jp/protocols/elisa-sample-preparation-guide-1

Cell/tissue extraction buffer recipe
100 mM Tris, pH 7.4
150 mM NaCl
1 mM EGTA
1 mM EDTA
1% Triton X-100
0.5% Sodium deoxycholate
Additional reagents required to produce complete extraction buffer.
Phosphatase inhibitor cocktail
Protease inhibitor cocktail
PMSF

上記がその組成ですが、これだとEGTA以外の試薬はあります。ここで質問なのですが、

1.EGTAがなくてもタンパク抽出液として機能するか?
2.もしEGTAをなしでやるとするとEDTAを2倍にしたほうがよいか?
3.EGTAの代わりになる他の試薬があるか?またその濃度は?
4.このcell extraction bufferはウェスタンブロットにも使えるか?

以上につきまして、アドバイス賜りますと幸いです。
 
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(無題) 削除/引用
No.4259-3 - 2015/07/11 (土) 23:17:55 - 小児科医師(ゆとり教育)
おおさん、ご回答ありがとうございました。おかげさまで心強く、明日の実験に臨むことができます。今後もご指導よろしくお願いします。

(無題) 削除/引用
No.4259-2 - 2015/07/11 (土) 15:37:48 - おお
>[Re:1] 小児科医師(ゆとり教育)さんは書きました :
> いつもお世話になっております。
>
> 培養細胞(SH-SY5Y)からタンパクを抽出し、Elisa、ウェスタンブロットを行う実験を新たに始めるところです。タンパク抽出液にInvitrogen FNN0011を検討していたのですが、組成が公開されており買うのももったいないと思って自作しようとしたら、EGTA、NaF、Na4P2O7、Na3VO4といろいろと試薬がありませんでした


NaF、Na4P2O7、Na3VO4はPhosphatase inhibitor cocktailのなかに入っているか、同様の効果があるものが入っていると思います。


>
> 1.EGTAがなくてもタンパク抽出液として機能するか?
Yes

> 2.もしEGTAをなしでやるとするとEDTAを2倍にしたほうがよいか?
する必要はあまり感じませんがしてもいいでしょう。


> 3.EGTAの代わりになる他の試薬があるか?またその濃度は?
お気づきでしょうけどEDTAはある程度代用になり得ます。カルシウム依存のプロテアーゼの阻害を考えるならprotease inbihitorsでもおぎなえる可能性があります。


> 4.このcell extraction bufferはウェスタンブロットにも使えるか?
Yes. 組成はいわゆるSDS free RIPA bufferです。

Elisa用タンパク抽出液(自作) 削除/引用
No.4259-1 - 2015/07/11 (土) 06:43:38 - 小児科医師(ゆとり教育)
いつもお世話になっております。

培養細胞(SH-SY5Y)からタンパクを抽出し、Elisa、ウェスタンブロットを行う実験を新たに始めるところです。タンパク抽出液にInvitrogen FNN0011を検討していたのですが、組成が公開されており買うのももったいないと思って自作しようとしたら、EGTA、NaF、Na4P2O7、Na3VO4といろいろと試薬がありませんでした。

細胞は実験を始めないといけない状態になっており、上記の試薬が研究室にないことが判明したのが金曜日の18時で、周りの研究室(複数)に聞いて回ったのですがいずれも持っていませんでした(平日は臨床や講義で試薬を調べる時間がありませんでした)。卸業者に至急、FNN0011を持ってきてもらおうとしたのですが在庫を持っていないそうで無理でした。

日曜日にはタンパクを回収しないといけないので、他のプロトコールを探していてAbcamのELISA sample preparation guideをみつけました。

ELISA sample preparation guide
ttp://www.abcam.co.jp/protocols/elisa-sample-preparation-guide-1

Cell/tissue extraction buffer recipe
100 mM Tris, pH 7.4
150 mM NaCl
1 mM EGTA
1 mM EDTA
1% Triton X-100
0.5% Sodium deoxycholate
Additional reagents required to produce complete extraction buffer.
Phosphatase inhibitor cocktail
Protease inhibitor cocktail
PMSF

上記がその組成ですが、これだとEGTA以外の試薬はあります。ここで質問なのですが、

1.EGTAがなくてもタンパク抽出液として機能するか?
2.もしEGTAをなしでやるとするとEDTAを2倍にしたほうがよいか?
3.EGTAの代わりになる他の試薬があるか?またその濃度は?
4.このcell extraction bufferはウェスタンブロットにも使えるか?

以上につきまして、アドバイス賜りますと幸いです。

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