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リン酸化部位の同定
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No.4251-TOPIC - 2015/07/07 (火) 17:00:47 -
たく
質問させていただきたいのですが、あるキナーゼがある遺伝子をリン酸化するとき(この遺伝子自体のリン酸化部位は複数解明されているもの)、このキナーゼが遺伝子のどの残基をリン酸化しているとかを調べようとするには質量分析を用いるのが妥当なのでしょうか?
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No.4251-4 - 2015/07/08 (水) 09:01:35 -
TS
実際にどこがリン酸化されているか、という点については、そのタンパク質が容易に分離できて、そこそこ用意できるのであれば、個人的には質量分析を好みます。
おおさんの挙げられている変異体を作成して32Pを見るのも選択肢の一つとは思いますが、私の提案も含めて、ご自身の研究環境によって決めるのが適切と思います。
RIが使いやすく、変異体の作成もルーチンでやられている、とか、
研究施設内に格安で質量分析を受託してくれる施設があるか、などの状況ですね。
(無題)
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No.4251-3 - 2015/07/08 (水) 05:39:53 - おお
site direct mutagenesis combined with phosphorylation assay using 32P or with isoelectric forcusing.
(無題)
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No.4251-2 - 2015/07/08 (水) 01:53:31 - くぁswでfrtgyふじこlp
割りと調べられてる蛋白質なら特定部位がリン酸化されたフォームに対する特異抗体売ってる。でもまだそんなに有名でないやつは売ってないことがおおい。なので自作するか、作ってる人からもらうかする。でもリン酸化フォームに対する抗体の特異性はかなり慎重に検討したほうがいい。実際、特異性が緩くて非リン酸化フォームも認識してしまうのもある。はじめは大丈夫でもだんだんそんな感じになるのもある。できるだけモノクロの方がいいかもしれない。
リン酸化部位の同定
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No.4251-1 - 2015/07/07 (火) 17:00:47 -
たく
質問させていただきたいのですが、あるキナーゼがある遺伝子をリン酸化するとき(この遺伝子自体のリン酸化部位は複数解明されているもの)、このキナーゼが遺伝子のどの残基をリン酸化しているとかを調べようとするには質量分析を用いるのが妥当なのでしょうか?
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