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(無題) 削除/引用 No.4249-16 - 2015/07/07 (火) 22:05:45 - fi とりあえずコマンドプロンプトへ打ち込んだ内容と出てきたエラーをコピー＆ペーストでもして示す方がいいかも。 例： C\Users\wao> blastp -version blastp: 2.2.30+ Package: blast 2.2.30, build Jan 27 2015 02:16:17 C\Users\wao>

(無題) 削除/引用 No.4249-15 - 2015/07/07 (火) 21:11:22 - AP Cドライブ直下に置いたらどうでしょうか。

(無題) 削除/引用 No.4249-14 - 2015/07/07 (火) 20:44:29 - わお AP様 置き場所も気になったので、Cドライブ＞user>英数字フォルダ名のフォルダ中に場所を置き換えました。しかし、同じエラーが続きます。。。 一つ気になるのは、windowsでフォルダを開いたときに、USERのフォルダがカタカナ表記になっています。コマンドプロンプトではC:\Users\英数字フォルダと表示されます。これが原因かなとも思い、場所を変えましたがダメですね。。 fi様、橘様 fastaファイルはdbと同じ場所で上記のCドライブ中に保存しております。 アクセス権についても、ご指導のとおり確認しましたが、所有者は自分になっていますし、アクセス権も許可となっておりました。 何が原因なんでしょうか。。手詰まりになりそうです。

(無題) 削除/引用 No.4249-13 - 2015/07/07 (火) 19:56:26 - 橘 念のため確認しておきたいのですが、「カレントディレクトリ」は何のことかお分かりでしょうか。fiさんの質問とほとんど同じですし、他のPCで実行されているということで多分問題ないとは思うのですが、一応確認です。 それはおそらくOKとして、ファイルの所有者やアクセス許可の問題については、Windowsのバージョンによって少し違いがあるかもしれません。 私が使っているWindows 8.1 Proでは、以下のように確認できます。 エクスプローラで該当ファイルのあるフォルダを開く ファイルを右クリック 「プロパティ」をクリック 「セキュリティ」タブを選択 「詳細設定」をクリック 「〜のセキュリティの詳細設定」というウィンドウが開く 上方に「所有者」が表示されているので自分になっているかどうか確認 「アクセス許可」タブに「アクセス許可エントリ」のリストがあるので、自分、もしくは自分が所属しているグループに読み取り権限があるかどうか確認 所有権やアクセス許可を取得するには以下のようにします。 エクスプローラでC:\Windows\System32の内容をを表示 cmd.exeを右クリックしてメニューの「管理者として実行」をクリック cd /d C:\hogehoge\fugafuga などと実行して当該ファイルのあるディレクトリへ移動 takeown /f ファイル名 で所有権を取得 icacls ファイル名 /grant ユーザー名:F でフルコントロール権限を取得

(無題) 削除/引用 No.4249-12 - 2015/07/07 (火) 15:49:42 - fi 実行するとき、fastaファイルが保存してあるフォルダに移動した？or 指定した？

(無題) 削除/引用 No.4249-11 - 2015/07/07 (火) 15:44:58 - AP プログラム本体をインストールしたときに、どのディレクトリに置きましたか？ programなどのディレクトリだとやはりpathのエラーがでる可能性があります。 これもルート直下にしたほうが無難です。

(無題) 削除/引用 No.4249-10 - 2015/07/07 (火) 15:34:27 - AP >他のPCで同じファイルを実行できるので、ファイルの問題ではないのでしょうか。 では文字コード、改行コードの違いということではないですね。 （半角文字に混じって、紛らわしい日本語フォントが一ヶ所入っているだけでエラーになるなんてことは、ありがちですが）

(無題) 削除/引用 No.4249-9 - 2015/07/07 (火) 15:28:41 - わお 橘様 ありがとうございます。 テキストファイルで開きましたが、改行コードと文字コードがどのような場合だとエラーになるのでしょうか。 他のPCで同じファイルを実行できるので、ファイルの問題ではないのでしょうか。 AP様 確かにシステム上の問題のようですね。所有権やアクセス権はどこで確認できますでしょうか。 ｗ様、たていす様 すみません。vernumberもきちんと記されていたのですが、書くのが面倒でーーーにしてしまいました。申し訳ございません。ですのでインストールはうまくいっていると思われます。

(無題) 削除/引用 No.4249-8 - 2015/07/07 (火) 15:04:26 - たていす blastp -version　を実行すると、おそらくprotein blastのバージョンが表示されるのでしょうから、うまくインストールされていないような気がします。 > blastp -version blastp: 2.2.30+ Package: blast 2.2.30, build Jan 27 2015 02:16:17 こんな感じになると思います。

(無題) 削除/引用 No.4249-7 - 2015/07/07 (火) 14:54:57 - vv > blastのインストール自体はうまくいっているようで、コマンドプロンプトで「blastp -version」で検索すると、 バージョンナンバーとかが出てくるのでは？？ bi.biopapyrus.net/win/win-blast.html

(無題) 削除/引用 No.4249-6 - 2015/07/07 (火) 14:43:31 - AP ファイルが読めないとフォーマットが違うとかいうんじゃんくて、、File is not accessible　アクセス出来ないというのだからpathやファイル名などファイルシステムの問題が臭いと思うんですが。アクセス権も怪しいですが、だったらそのような表現で表示されそうなもんですが、

(無題) 削除/引用 No.4249-5 - 2015/07/07 (火) 13:55:58 - 橘 あとは所有者やアクセス許可が変になってしまっているかもしれませんのでご確認下さい。

(無題) 削除/引用 No.4249-4 - 2015/07/07 (火) 13:50:49 - 橘 そのfastaファイルをちゃんとしたテキストエディタ(フリーならサクラエディタとか)で開いて、改行コードと文字コードを確認してみては。あと配列の名前に変な文字使ってないか。

(無題) 削除/引用 No.4249-3 - 2015/07/07 (火) 11:37:15 - わお AP様 ありがとうございます。確認しました。pathに英数字のみのところに保存しなおしましたが、同じエラーになります。 OS環境は、Win 64bit です。 blastのインストール自体はうまくいっているようで、コマンドプロンプトで「blastp -version」で検索すると、「package blast----built」と表示されます。 やはり、queryのファイル自体がだめなのでしょうか。 queryファイルは、blastから塩基配列をコピーし、fastaファイルに置き換えています。

(無題) 削除/引用 No.4249-2 - 2015/07/06 (月) 13:02:36 - AP そのプログラム知りませんし、OS環境などもはっきりしませんが、 ひょっとすると、pathに日本語が使われていると通らないというやつかも。 Windowsで外国産の非商用学術プログラムなんかを動かすときにありがちなんですが。 例えばデスクトップに置いてあるファイルなんかはpathの中に「デスクトップ」という日本語文字列が入っているため通りません。ルートディレクトリに半角名のディレクトリ（フォルダ）を作って、データはすべてそこに収納するとトラブルになりにくいと思います。

blast + コマンドプロンプト 削除/引用 No.4249-1 - 2015/07/06 (月) 12:40:27 - わお blast+でdbを構築し、クエリとの相同性検索を行っているのですが、クエリの作成したfastaファイルに、File is not accessible とエラーが出ます。 同じファイルを別のパソコンで検索をかけるとうまく計算してくれます。 コンピュータ側の問題でしょうか。 ご存知の方、ご教授よろしくお願いいたします。

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