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PCRによるalleleの増幅効率
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No.4199-TOPIC - 2015/06/19 (金) 22:05:43 - 〜
ゲノムPCRについて質問致します。
ゲノムDNAをテンプレートとした時、PCRで増幅される鋳型は2個のアリルに均等に由来するのでしょうか? どちらかのアリルが優先的に増幅される事はありますか?
マイクロサテライトを増幅した時に、ヌルアリルが見られることがあるようですが、これはどちらか一方のアリルから優先的に増幅されているからなのでしょうか? もし優先的に増幅されるとしたら、その理由を教えて頂けますようお願い致します。それに関する論文情報がありましたら、合わせてご教示頂けますようお願いします。
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No.4199-2 - 2015/06/19 (金) 22:42:35 - おお
可能性はいろいろ想像できますが、、、
プライまー結合部位の変異、SNPsとか、アンプリコンの長さの違いとか、修飾などによるプライまーのアフィニティーの違いとか、配列、修飾の違いによる2次構造の違いとか。
PCRによるalleleの増幅効率
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No.4199-1 - 2015/06/19 (金) 22:05:43 - 〜
ゲノムPCRについて質問致します。
ゲノムDNAをテンプレートとした時、PCRで増幅される鋳型は2個のアリルに均等に由来するのでしょうか? どちらかのアリルが優先的に増幅される事はありますか?
マイクロサテライトを増幅した時に、ヌルアリルが見られることがあるようですが、これはどちらか一方のアリルから優先的に増幅されているからなのでしょうか? もし優先的に増幅されるとしたら、その理由を教えて頂けますようお願い致します。それに関する論文情報がありましたら、合わせてご教示頂けますようお願いします。
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