Bio Technical フォーラム

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RNA抽出の前のPBS洗浄 トピック削除
No.4071-TOPIC - 2015/05/05 (火) 22:44:50 - protein
基本的なことですが皆様の考えを聞かせてください。
QiagenなどのカラムベースのRNA抽出では、細胞の溶解の前にPBSでwashすることが作法とされています。が、この操作は実際のところどれほどcriticalなのでしょうか。

現在100−500個程度の細胞を短期培養しqPCRを行っていますが、
Preampをしてもシグナルが弱く、上記のような洗浄過程で細胞をロスしているのではと懸念しています。なので、ある程度培養上清を除いた後、直接lysis bufferに移せないかと思っている次第です。
 
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(無題) 削除/引用
No.4071-4 - 2015/05/06 (水) 00:33:35 - protein
おおさん、アドバイスありがとうございます!
私は浮遊細胞を使っていますので、washの際は常に遠心が必要でして
タンパク質を含まないバッファーだと細胞の落ちが悪いということはしばしば耳にします。
次はPBS洗浄無しでやってみます。

(無題) 削除/引用
No.4071-3 - 2015/05/05 (火) 23:01:18 - おお
でも洗ってロスしているかは保証の限りではありません。収量はかわらないかも、、、

(無題) 削除/引用
No.4071-2 - 2015/05/05 (火) 22:59:45 - おお
洗わなくても大丈夫だと思います。
ディシュで飼っている細胞を、培地をすててすぐにlysis bufferをかけるとかやることもあります。

実験によっては余分なストレスがかかるので 洗わない方がいいというかたもいらっしゃると思います。

RNA抽出の前のPBS洗浄 削除/引用
No.4071-1 - 2015/05/05 (火) 22:44:50 - protein
基本的なことですが皆様の考えを聞かせてください。
QiagenなどのカラムベースのRNA抽出では、細胞の溶解の前にPBSでwashすることが作法とされています。が、この操作は実際のところどれほどcriticalなのでしょうか。

現在100−500個程度の細胞を短期培養しqPCRを行っていますが、
Preampをしてもシグナルが弱く、上記のような洗浄過程で細胞をロスしているのではと懸念しています。なので、ある程度培養上清を除いた後、直接lysis bufferに移せないかと思っている次第です。

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