質問させてください。
SWISS-MODELを使って構造未知のタンパク質Xの構造予測を行いました。
この予測されたタンパク質Xの構造が、Xのホモロジータンパク質Y(構造は既知です)とどの程度似ているかを比較したいです。その比較はTopmatchを用いることにしています。
質問なのですが、タンパク質YのPDBファイルは入手しましたが、予測されたタンパク質XのデータをTopmatchで認識されるようにしたいです。そのためにPDBファイルにしなくてはならないと思うのですが、SWISS-MODELで得られたデータをPDBファイルに変換する方法をご教示いただけますと幸いです。
大変稚拙な質問で恐縮ですが、どうかよろしくお願いいたします。 |
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