Bio Technical フォーラム

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alleleの起源 トピック削除
No.3963-TOPIC - 2015/03/25 (水) 23:05:20 - jas
ある1塩基置換の進化の解析を行っています。
その塩基は現代人の中ではどの人種でも20%ほどの割合でみられますが、ネアンデルタール人では見られません。
解析できるネアンデルタール人の数は限られていると思うのですが、この塩基置換が旧人類から分岐したのちに初めて出現したことを証明するのはどうしたらいいんでしょうか?
 
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(無題) 削除/引用
No.3963-3 - 2015/03/28 (土) 10:43:31 - 通りすがりA
そちらの方面には疎く、間違っていたらすみません。

あなたが着目している以外の塩基多型が近傍に散在していると思います。それらの集団解析と比較してあなたが着目しているSNPの分岐年代を推定できませんか?

(無題) 削除/引用
No.3963-2 - 2015/03/27 (金) 00:52:10 - おお
例数はどれくらいそろうのですか?10-20ぐらいなら検出力は弱くなるけど、できなくはないと思いますが。もっと理詰めでやるなら、使える例数でpower analysisなどをやって、そこで差があるという条件でp値がどれくらいになって、それを指標にして判断するか。

あとは周辺のspeciesも含めて解析をしていくか。

alleleの起源 削除/引用
No.3963-1 - 2015/03/25 (水) 23:05:20 - jas
ある1塩基置換の進化の解析を行っています。
その塩基は現代人の中ではどの人種でも20%ほどの割合でみられますが、ネアンデルタール人では見られません。
解析できるネアンデルタール人の数は限られていると思うのですが、この塩基置換が旧人類から分岐したのちに初めて出現したことを証明するのはどうしたらいいんでしょうか?

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