Bio Technical フォーラム

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センスとアンチセンスの結合 トピック削除
No.3945-TOPIC - 2015/03/16 (月) 16:45:08 - くわちゃん
60塩基前後の遺伝子(センスとアンチセンス)を某メーカーに合成してもらっている最中です。5'端には、BamHIサイト(切断された状態)と3'端には、SalI-ggg-EcoRVサイト(EcoRVサイトは切断された状態)を組み込んであります。5'端には、リン酸化するよう依頼してあります。
この遺伝子のセンスとアンチセンスを結合させる手順ですが、以下の通りでよろしいでしょうか?(GCリッチな配列です)

1.50μLのdH2O入りのチューブをヒートブロックで96℃にする。
 (以前、似たような実験で、10 x PCR バッファーや dNTP mix を加えていたのですが、意味がないように思います・・・いかがでしょうか?)
2.センスとアンチセンスを適量それぞれ加える。
 (終濃度のマックスはどれぐらいまで可能でしょうか?)
3.5分間インキュベートベートする。
4.ヒートブロックのスイッチを切る。
5.37℃ぐらいになるまでそまま待つ。
6.一部をベクター(BamHIとEcoRVで切断後)に挿入する。

以上、よろしくお願いいたします。
 
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(無題) 削除/引用
No.3945-4 - 2015/03/17 (火) 07:41:33 - s
http://www.sigmaaldrich.com/technical-documents/protocols/biology/annealing-oligos.html

塩は? 削除/引用
No.3945-3 - 2015/03/16 (月) 20:22:20 - 774R
自分ならTENバッファーでやる。

(無題) 削除/引用
No.3945-2 - 2015/03/16 (月) 17:33:09 - 774
Primerを加えてから96℃でいいのでは?
Ligationするなら、最終的にはかなり希釈するので、
濃度は適当でいいんじゃないでしょうか。
僕だったら100uMを1:1で混ぜて結合させるかなと。

センスとアンチセンスの結合 削除/引用
No.3945-1 - 2015/03/16 (月) 16:45:08 - くわちゃん
60塩基前後の遺伝子(センスとアンチセンス)を某メーカーに合成してもらっている最中です。5'端には、BamHIサイト(切断された状態)と3'端には、SalI-ggg-EcoRVサイト(EcoRVサイトは切断された状態)を組み込んであります。5'端には、リン酸化するよう依頼してあります。
この遺伝子のセンスとアンチセンスを結合させる手順ですが、以下の通りでよろしいでしょうか?(GCリッチな配列です)

1.50μLのdH2O入りのチューブをヒートブロックで96℃にする。
 (以前、似たような実験で、10 x PCR バッファーや dNTP mix を加えていたのですが、意味がないように思います・・・いかがでしょうか?)
2.センスとアンチセンスを適量それぞれ加える。
 (終濃度のマックスはどれぐらいまで可能でしょうか?)
3.5分間インキュベートベートする。
4.ヒートブロックのスイッチを切る。
5.37℃ぐらいになるまでそまま待つ。
6.一部をベクター(BamHIとEcoRVで切断後)に挿入する。

以上、よろしくお願いいたします。

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