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Ensemblのゲノム情報に対してNCBIのRefSeqの選び方 トピック削除
No.3875-TOPIC - 2015/02/19 (木) 23:42:48 - 遊chem
現在、NCBI BLASTとMEMEというソフトウェアを使用して遺伝子上の共通配列の解析しようと考えています。そこでEnsemblからゲノム情報をNCBIから遺伝子の情報(RefSeq)を取得して解析を考えているのですが、それぞれの様々なリリースバージョンがあり、それぞれのサイトからどのバージョンを取得すれば問題なく使用できるのかが分からず困っています。
それぞれのリリースのどこの情報を参照すれば、お互い情報が対応しているのか確認できるのか御回答をよろしくお願いいたします。

Ensembl
ftp://ftp.ensembl.org/pub/
NCBI
ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/H_sapiens/ARCHIVE/BUILD.・・・
　
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Ensemblのゲノム情報に対してNCBIのRefSeqの選び方 削除/引用
No.3875-1 - 2015/02/19 (木) 23:42:48 - 遊chem
現在、NCBI BLASTとMEMEというソフトウェアを使用して遺伝子上の共通配列の解析しようと考えています。そこでEnsemblからゲノム情報をNCBIから遺伝子の情報(RefSeq)を取得して解析を考えているのですが、それぞれの様々なリリースバージョンがあり、それぞれのサイトからどのバージョンを取得すれば問題なく使用できるのかが分からず困っています。
それぞれのリリースのどこの情報を参照すれば、お互い情報が対応しているのか確認できるのか御回答をよろしくお願いいたします。

Ensembl
ftp://ftp.ensembl.org/pub/
NCBI
ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/H_sapiens/ARCHIVE/BUILD.・・・
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