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RNAlater による組織のつぶれ トピック削除
No.3704-TOPIC - 2015/01/06 (火) 16:59:53 - ハンドルネーム
一辺約100μm 程度の極微小組織サンプルを多検体から回収して RNA を調整したいと考えています。このために RNAlater を用いています。組織片をRNAlater に入れると組織片が浸透圧で?潰れてしまい、回収率も PBS 中にためていった時の10分の1程度に下がります。ただ、組織回収には半日かかるので PBS よりも RNAlater を用いたいです。
質問は、 RNAlater を用いると浸透圧で組織が潰れ、その結果 RNA が漏出して回収率が下がるのかと考えていますが、これは正しいでしょうか。また、私が考えている以外に回収率が下がる理由があればご教授いただければと思います。
 
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No.3704-4 - 2015/01/06 (火) 19:40:45 - AP
説明書には組織サンプルはの場合、RNAlaterに浸けるかクイックフリーズするか、RLT buffer中でホモジナイズするまでRNAは保護されないと書いていますが(逆に言うとホモジナイズすれば安定ということ)、それはある程度大きな(5 mm角)サンプルが想定されているようです。
100 um角くらい小さければ、細胞サンプルと同じようにRLT bufferを加えるだけで十分にlysisすると思います。心配なら、すぐに同じない程度にvortexでもかけとけば。

(無題) 削除/引用
No.3704-3 - 2015/01/06 (火) 19:10:47 - ハンドルネーム
AP 様
ありがとうございます。確かにその通りかもしれません。
lysis にはキアゲン RNeasy キットの純正品である RLT buffer を用いています。グアニジンイソチオシアネートを含有していますので、目的にかなっているかもしれません。
この件も含めましてご意見をいただければと思います。

(無題) 削除/引用
No.3704-2 - 2015/01/06 (火) 17:19:50 - AP
質問のポイントとは外れますが、
精製の系はどういうタイプのやつでしょうか?
組織片を摘出次第、最初から抽出溶液(AGPC、グアニジン含有ホモジナイズ溶液)に放りこんでいくことは出来ないんですか? こういう溶液中では保存がきくし、そのまま抽出操作に入ればロスもないでしょう。

RNAlater による組織のつぶれ 削除/引用
No.3704-1 - 2015/01/06 (火) 16:59:53 - ハンドルネーム
一辺約100μm 程度の極微小組織サンプルを多検体から回収して RNA を調整したいと考えています。このために RNAlater を用いています。組織片をRNAlater に入れると組織片が浸透圧で?潰れてしまい、回収率も PBS 中にためていった時の10分の1程度に下がります。ただ、組織回収には半日かかるので PBS よりも RNAlater を用いたいです。
質問は、 RNAlater を用いると浸透圧で組織が潰れ、その結果 RNA が漏出して回収率が下がるのかと考えていますが、これは正しいでしょうか。また、私が考えている以外に回収率が下がる理由があればご教授いただければと思います。

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