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Real time PCR
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No.3684-TOPIC - 2014/12/20 (土) 23:47:58 -
初心者
初めまして。Real time PCR初心者です。
ΔΔCT法を用いてReal time PCRを行いたいと思っています。そこでプレートの設計について質問です。ハウスキーピング遺伝子を2つおき、デュプリケイトで行いたいと考えています。この時に、NTCおよびNACをおくように先輩に教えられたのですが必要なのでしょうか。検体数およびプライマー数が多いためおかなくてよいのであればおきたくないのですが、論文等にする場合必要でしょうか。初歩的な質問ですみません。宜しくお願い致します。
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No.3684-6 - 2014/12/21 (日) 18:32:12 - おお
もう一度私のコメント、リンクなどをよんでよくかんがえてください。
追記
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No.3684-5 - 2014/12/21 (日) 17:34:48 -
初心者
追加で質問させて頂きます。
NTC、NACをおこうと考えています。NTCは試薬や主義的な問題でDNAが増幅されていないかという観点から各primer1well使用しようと考えています。
NACはそもそもRNAがちゃんととれているかを確認するものと認識しているのですが、各primerで1wellおく必要があるのでしょうか。
各検体ひとつのprimerでNACを設置すればよいのでしょうか。
(無題)
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No.3684-4 - 2014/12/21 (日) 14:59:14 -
初心者
返答ありがとうございます。
NTC、NACの認識が甘かったようです。先輩もPCRを常に行っているわけではなく、常時行っているヒトに実験の相談をできる環境に無いため他のプロトコールなどを参考にしたのですがどれもNTC、NACをおいていなかったので質問させて頂きました。
(無題)
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No.3684-3 - 2014/12/21 (日) 13:16:32 - おお
http://www.lifetechnologies.com/us/en/home/references/ambion-tech-support/rtpcr-analysis/general-articles/ten-most-common-real-time-qrt-pcr-pitfalls.html
これつけるのわすれてた。
(無題)
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No.3684-2 - 2014/12/21 (日) 09:18:07 - おお
NTC、NAC をおいてないデーターをあなたが見たとき、あなたはそのデーターをどのようにみるのですか?
NACはゲノムのコンタミが見れるとの解説もありますが、それ以上にその実験系でのいろんな意味でのバックグランドがみれます。
そう言うのをおけといわれているわけですから、いっている人とよくdiscussionしてください。意義についてここでいろいろな意見を聞くのはいいですけど、第三者の誰かわからない人の意見をきいて、NTC、NACは含めませんでしたと、あとになってその先輩に言うんですか?
Real time PCR
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No.3684-1 - 2014/12/20 (土) 23:47:58 -
初心者
初めまして。Real time PCR初心者です。
ΔΔCT法を用いてReal time PCRを行いたいと思っています。そこでプレートの設計について質問です。ハウスキーピング遺伝子を2つおき、デュプリケイトで行いたいと考えています。この時に、NTCおよびNACをおくように先輩に教えられたのですが必要なのでしょうか。検体数およびプライマー数が多いためおかなくてよいのであればおきたくないのですが、論文等にする場合必要でしょうか。初歩的な質問ですみません。宜しくお願い致します。
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