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1000細胞ー後期胚まで共通で可能なcDNAライブラリ作製法 トピック削除
No.3683-TOPIC - 2014/12/20 (土) 20:06:38 - 学部生

卒業研究中の学部4年生です。

RNA-seqを1個体=1サンプルとして行いたいと考えています。
このサンプルには魚類の初期胚(1000細胞強程度)〜後期胚(孵化直前)まであり、このように細胞数が異なるサンプルでも同じ手順でcDNAライブラリを作りたいのです。

研究室内にはQuartz-seqを行う者もおり、少数細胞には対応できるのですが、後期胚にも適用できるかはわからないと言われています。
液体窒素でサンプルを凍結・すりつぶして一部を使う…とするしかないでしょうか?

また、できるだけ増幅をかけずにライブラリを作りたいのですが、1000細胞程では可能ですか?
市販のキットでも新たに買えますので、是非ご教授願います。
 
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1000細胞ー後期胚まで共通で可能なcDNAライブラリ作製法 削除/引用
No.3683-1 - 2014/12/20 (土) 20:06:38 - 学部生

卒業研究中の学部4年生です。

RNA-seqを1個体=1サンプルとして行いたいと考えています。
このサンプルには魚類の初期胚(1000細胞強程度)〜後期胚(孵化直前)まであり、このように細胞数が異なるサンプルでも同じ手順でcDNAライブラリを作りたいのです。

研究室内にはQuartz-seqを行う者もおり、少数細胞には対応できるのですが、後期胚にも適用できるかはわからないと言われています。
液体窒素でサンプルを凍結・すりつぶして一部を使う…とするしかないでしょうか?

また、できるだけ増幅をかけずにライブラリを作りたいのですが、1000細胞程では可能ですか?
市販のキットでも新たに買えますので、是非ご教授願います。

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