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EGFPとsfGFP トピック削除
No.3588-TOPIC - 2014/11/26 (水) 23:17:17 - 蛍光
Green fluorescent proteinを使う場合はEGFPがgold standardとなっていると思いますが、Super folder GFPはほとんど同じ波長で使用でき、より安定だと思うのですが、EGFPよりもsfGFPを使う事のデメリットがあるのでしょうか?
 
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No.3588-6 - 2014/11/28 (金) 16:09:55 - toto
EGFPはこの世に出てからすでに20年も経ちます。今ではよりモノマーで、輝度の高く蛍光基形成に要する時間の短いものがSuperfolderをはじめていろいろと出てます。

Addgeneに気軽に入手できる蛍光蛋白ガイドがありますが、昔からの融合ベクターを使うならともかく、新しいコンストラクトを作るのにEGFPをあえて使うというのは、どうですかね。Superfolderはそれの一つの改良型で、特にデメリットは感じたことありません。pKは、このファミリーではあまり変わらないように思います。mCherryなどのDsRed由来のは低いので酸性環境用に使われますね。

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No.3588-5 - 2014/11/27 (木) 18:18:13 - 蛍光
コメントありがとうございます。

確かに、今でも改良されているものがでてくるから、良いものを求めたらキリがないかもですね。EGFPで十分ならEGFPを使った方がトラブルが起きても、原因を調べやすそうですし。

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No.3588-4 - 2014/11/27 (木) 00:22:36 - おお
手元にEGFPの空ベクターもってたら、それつかっちゃうかもですね。まえの実験でつくったコンストラクトの比較の可能性とかあればおなじバックボーンでないといけないし。

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No.3588-3 - 2014/11/26 (水) 23:56:44 - AA
sfGFPは融合タンパク質を作った時に相方となるタンパクの影響で
フォールディングが変化しない、というのが特徴のようですから、
単独で発現させるのであれば、あまり違いはないかもしれないですね。

GFPの改変はいつも行われている印象ですので、最新のものでよく調べると
いろいろあるかもしれないですね。
(蛍光強度、pH変化、などなど。熱耐性GFPというのもトライされているようです)

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No.3588-2 - 2014/11/26 (水) 23:42:20 - おお
比較的新しいですからね。いろいろEGFPでコンストラクトを作って持っていたらな、変える必要もないかもしれません。また出来合いのコンストラクトを他のラボからいただいたり、addgeneで探したりすると、sfGFPのコンストラクトはすくないでしょう。

EGFPは細胞内で安定で半減期が長く、経時的な変動を追いにくいので敬遠されることもありますが、sfGFPはどうなんでしょうか。pH変動でどの程度変わるかというのも興味があります。

EGFPとsfGFP 削除/引用
No.3588-1 - 2014/11/26 (水) 23:17:17 - 蛍光
Green fluorescent proteinを使う場合はEGFPがgold standardとなっていると思いますが、Super folder GFPはほとんど同じ波長で使用でき、より安定だと思うのですが、EGFPよりもsfGFPを使う事のデメリットがあるのでしょうか?

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