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(無題) 削除/引用 No.3584-9 - 2014/11/25 (火) 16:48:08 - R cDNA用の場合、 プライマー自身がイントロンをまたいでいる場合もあるので、 ご留意下さい。

プライマーの結合部位がわかる模式図を作りたいです 削除/引用 No.3584-8 - 2014/11/25 (火) 15:32:51 - い 生物種はHomo sapiensです。 Windowsを使ってるので Blastでやってみます！ ありがとうございます。

(無題) 削除/引用 No.3584-7 - 2014/11/25 (火) 15:29:04 - おお http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/ ここにプライまーの配列をほりこめばいいとおもう。 テンプレートの配列はいれてもいいけど、入れずに適切なデーターベースを選んでおけばターゲットの遺伝子もみつけてくれる。

プライマーの結合部位がわかる模式図を作りたいです 削除/引用 No.3584-6 - 2014/11/25 (火) 15:01:23 - い 手持ちの情報は NCBIからひっぱてきた遺伝子配列と 論文に記載されていたプライマー（forwardとreverse）の配列です。 また、論文にはアクセッション番号・配列どの位置をプライマーにしたのか は書かれていませんでした。 Wordを使ってやってみます。 ありがとうございます！

(無題) 削除/引用 No.3584-5 - 2014/11/25 (火) 14:48:33 - seven プライマー配列とターゲット周辺のDNA配列があればAmplifyというMac用のソフトでなんとかなるかも。 生物種によってはプライマー配列をblastにかけてもいけます。

(無題) 削除/引用 No.3584-4 - 2014/11/25 (火) 14:17:19 - ~ >DNAへの結合部位の調べ方が知りたいです。 手持ちの情報としては何があるのでしょうか？ 遺伝子側の配列と、プライマーの配列は電子データとして入手可能ですよね。 どのアクセッション番号の配列のどの位置をプライマーにしたのかまで 論文に書かれているのでしたら、その番号で場所が分かります。 論文に配列の場所が書かれていない場合、 ワードで遺伝子側の配列のファイル(改行や数字を削除済み)を開き、 プライマーの配列(相補鎖の場合は相補配列)で検索すればヒットします。

プライマーの結合部位がわかる模式図を作りたいです 削除/引用 No.3584-3 - 2014/11/25 (火) 14:09:38 - い 解答ありがとうございます。 質問の書き方が悪かったです。すみません。 DNAへの結合部位の調べ方が知りたいです。 よろしくお願いします。

(無題) 削除/引用 No.3584-2 - 2014/11/25 (火) 13:53:00 - おお パワーポイントで線ひいて書いたぐらいの図じゃだめなのかな。。。

プライマーの結合部位がわかる模式図を作りたいです 削除/引用 No.3584-1 - 2014/11/25 (火) 13:09:31 - い いつも有益な情報をありがとうございます。 論文からPCRで使う複数のプライマーを購入ました。 これらのプライマーがDNAのどの辺に結合するかを示す図を 書きたいのですが、方法がわかりません。 実験内容に関わる質問じゃなく申し訳ありませんが、 どなたか教えて頂けないでしょうか？

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