BioTechnicalフォーラム [フローサイトメトリーのおすすめ解析ソフトは？]

フローサイトメトリーのおすすめ解析ソフトは？

No.3493-TOPIC - 2014/10/30 (木) 09:05:02 - おふろ

いつも参考にしています。最近フローサイトメトリーを使う機会がありまして、解析ソフトをひとつラボに入れようかなと思っております。お勧めのソフトはありますでしょうか？

以前、BD社のサイトメトリーを使ってまして、そのときはFlowJoで解析を行っていました。現在別施設におり、ここでもBD製のフローがあるのですがいつも混んでいて、Beckman Coulter製のが比較的すいているので使ってみました。FlowJoの体験版を使って昔のように解析しようとしたのですがデータがうまく表示されずまいりました。今後Beckman Coulterの機械は使わずBDだけ使って解析は慣れているFlowJoでしようか、もしくはKaluzaの方がいいのかな、と思っています。みなさんのご経験からお勧めのソフトはないでしょうか？

ちなみにとりあえず今やっているフロー実験はシンプルにPI染色の細胞周期解析です。今後は2、3色で染めることもあるでしょうが、7色8色同時に使うかはどうかなー？というところです。（以前の施設では一度だけやったことがあるのですが、今のラボでもやるかは未定。）使いやすくて幅広い解析もでき、きれいな図が出るお勧めソフトをみなさんのご経験から教えていただけないでしょうか。よろしくお願いします。
　

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No.3493-5 - 2014/11/06 (木) 04:03:26 - おふろ

proteinさん、ありがとうございます。ベックマンのデータ形式がLMDで、ジョーで開くと軸のパラメータを変えるときにベックマンのフローで使っていたパラメータがリストにないんです。体験版だからなのでしょうか。近くBD製のサイトメーターでデータを取るのでそのデータと、Kaluzaも無料体験版を入れてみていろいろ試してみようかなと思っておりますが、やっぱりジョーがいいですかね。どうもありがとうございました。

他にもご使用経験がありましたらよろしくお願いします。

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No.3493-4 - 2014/11/05 (水) 22:06:53 - protein

今のFlowJoの体験版ってデモデータしか開けないように思うのですがどうでしょうか。
また基本的にはBDだろうがBeckmanだろうが、FlowJoで扱うぶんには差がないように思います。
費用が許すならFlowJoかなと思います。

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No.3493-3 - 2014/11/04 (火) 08:49:47 - おふろ

スーパーさん、お返事ありがとうございます。コンピューターに疎いもので理解するのが難しいと感じております・・・・しかしながらFlowJoがやはりポピュラーなのですかね。

他にもご使用経験がありましたらよろしくお願いします。

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No.3493-2 - 2014/11/03 (月) 09:49:56 - スーパー

FlowJo起動用のUSB(中身はCPUではなくただ単に記憶素子)のハードウェア情報(デバイスIDなど)と、内部に保存されてるファイルの両方を、別のUSBに上書きする。