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フォワードプライマーを除いてのPCRについて
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No.3487-TOPIC - 2014/10/27 (月) 21:52:00 - PCR
目的のDNA断片をリバースプライマーだけ使用して増幅することはできますか?
できるならサイクル数がふえるごとにどのようにふえていきますか?
よろしくお願いします。
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No.3487-6 - 2014/10/29 (水) 13:34:16 - 中年
プライマー一方のみなら、chain reactionではありませんね。授業の小テストか何かですか?
指数増幅後不要鎖分解
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No.3487-5 - 2014/10/29 (水) 12:09:02 - ふみ
フォワードプライマの5'端をリン酸化しておいて、フォワードとリバースでPCRして、lambda exonucleaseでフォワードプライマ由来鎖を分解すると、リバースプライマ由来断片が沢山できるという方法があったかと思います。PCRさんがやりたいことに適合するかどうかわかりませんが。
(無題)
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No.3487-4 - 2014/10/29 (水) 03:17:52 - おお
ちなみにその方法はいろいろと応用例があるとおもいます。
一本鎖のプローブ作成とか、シーケンスとか、あとsite direct mutagenesisでも使われたりするんじゃないかな
PCRで一方のプライまーがあまりよくないとき、もう一方だけでなんサイクルかまわして、だめな方のプライまーがアニーリングしやすい状態にしてから、そのプライまーをくわえてPCRするというのもきいたことがあります。
(無題)
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No.3487-3 - 2014/10/27 (月) 23:14:24 - おお
DNAは増えますが増え方はlinearで20サイクルなら理想的には1サイクルの時に比べて20倍。通常のPCRは20サイクルなら10^6倍くらいですね。
もちろんそのプライまーを含む鎖のsingle strandしかできません。
(無題)
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No.3487-2 - 2014/10/27 (月) 22:11:26 - 774R
長さの不揃いな一本鎖がサイクル数分増えます。
フォワードプライマーを除いてのPCRについて
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No.3487-1 - 2014/10/27 (月) 21:52:00 - PCR
目的のDNA断片をリバースプライマーだけ使用して増幅することはできますか?
できるならサイクル数がふえるごとにどのようにふえていきますか?
よろしくお願いします。
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