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(無題) 削除/引用 No.3470-4 - 2014/10/20 (月) 15:36:26 - おお ttp://psfs.cbrc.jp/tmbeta-net/ I found this.

(無題) 削除/引用 No.3470-3 - 2014/10/20 (月) 12:22:04 - サンショウウオ www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=2JMM PDBID:2JMMをテンプレートに指定してSwissmodelでホモロジーモデリングしてみるとか。。。。かな？ 構造はともかく、貫通領域予測ぐらいにはつかえそうかも。 http://swissmodel.expasy.org/interactive

(無題) 削除/引用 No.3470-2 - 2014/10/20 (月) 11:20:56 - bet 詳しくないので間違っているかもしれませんが、betaストランド型用のソフトは使えないのでしょうか？ bioinformatics.biol.uoa.gr/PRED-TMBB/ gpcr.biocomp.unibo.it/cgi/predictors/outer/pred_outercgi.cgi www.imtech.res.in/raghava/tbbpred/ bioinformatics.bc.edu/clotelab/transFold/

膜貫通領域予測 削除/引用 No.3470-1 - 2014/10/20 (月) 10:41:12 - 膜貫通領域予測 お世話になっております。 膜貫通蛋白質（betaストランド型）の膜貫通領域予測をしたいと思い、SOSUI、TMHMMなど様々な解析ソフトを利用しております。 しかし、X線解析によって8回膜貫通蛋白質と報告された蛋白質（betaストランド型）のアミノ酸配列をポジコンとして解析しても、膜貫通蛋白質として解析されません。 ある文献より、betaストランド型は、alfaへリックス型に比べ構造予測が難しいことがわかりました。 膜貫通蛋白質（betaストランド型）の膜貫通領域は、どのような方法で解析するとよろしいでしょうか。 ご教授いただけましたら、幸いです。 よろしくお願い致します。

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