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発現ベクターがワークしない トピック削除
No.3440-TOPIC - 2014/10/07 (火) 09:47:49 - エネゴリ
発現ベクターがワークしないので質問させてください。致命的な間違いがあればご指摘を受けたいです。
EF1Pro-cDNA-F2A-EGFP-pAの発現ベクターを構築し、マウスES細胞にトランスフェクションで入れても、全くEGFPが光りません。コントロールであるEF1Pro-F2A-EGFP-pAはEGFP (cDNAを含まない)は、トランスフェクションして24時間後にEGFP陽性の細胞を多く観察できたので、トランスフェクションには問題ないと考えてます。ベクターの配列に何か致命的な間違いがあるのでしょうか?
 
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No.3440-9 - 2014/10/07 (火) 22:32:09 - おお
おかしいと思ったら、真っ先に確認するところだったのでずっこけてます。

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No.3440-8 - 2014/10/07 (火) 12:23:05 - エネゴリ
ささいなことでずっこけていました。感謝してます。

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No.3440-7 - 2014/10/07 (火) 11:40:37 - ごんべえ
お役に立てて光栄です〜。

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No.3440-6 - 2014/10/07 (火) 11:27:11 - エネゴリ
発見しました。F2Aの前に終始コドンが入ってました。ご指摘ありがとうございました。助かりました。

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No.3440-5 - 2014/10/07 (火) 10:27:44 - ごんべえ
F2AでつなげているのでcDNAの後にstop codonをいれていないか、cDNA以後Frame shiftしてないかはもちろん確認済みですよね?

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No.3440-4 - 2014/10/07 (火) 10:23:15 - エネゴリ
ベクターのcDNA~pAまでシーケンスで確認して、mutationは入っていませんでした。cDNAの配列は、他の論文のクローニング領域をまねたので大丈夫とは思ってましたが・・・。トランスフェクション効率が低い可能性もありましたね。。。

(無題) 削除/引用
No.3440-3 - 2014/10/07 (火) 10:05:59 - ~
現時点では何がどこまで確認できているのでしょうか?

>EF1Pro-cDNA-F2A-EGFP-pAの発現ベクターを構築
のEGFPが削れていれば、光らなくてもおかしくありませんし、
プロモーターを削っていても光らなくてもおかしくありません。

ベクターの精製度が低く、トランスフェクション効率が非常に低い場合も光りませんね。

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No.3440-2 - 2014/10/07 (火) 09:59:04 - おお
いやそれだけじゃあちょっとわかりませんよ。考えられることはフレームがあっているかどうかと開始コドン周辺の配列、5'UTRが含まれているかとか、、、

発現ベクターがワークしない 削除/引用
No.3440-1 - 2014/10/07 (火) 09:47:49 - エネゴリ
発現ベクターがワークしないので質問させてください。致命的な間違いがあればご指摘を受けたいです。
EF1Pro-cDNA-F2A-EGFP-pAの発現ベクターを構築し、マウスES細胞にトランスフェクションで入れても、全くEGFPが光りません。コントロールであるEF1Pro-F2A-EGFP-pAはEGFP (cDNAを含まない)は、トランスフェクションして24時間後にEGFP陽性の細胞を多く観察できたので、トランスフェクションには問題ないと考えてます。ベクターの配列に何か致命的な間違いがあるのでしょうか?

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