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(無題) 削除/引用 No.3372-6 - 2014/09/13 (土) 08:36:50 - おお ncRNAとかじゃないですよね。。。

(無題) 削除/引用 No.3372-5 - 2014/09/13 (土) 08:08:53 - Harmonia No.3372-1は、いつもと雰囲気が違うと思ってましたが... いま時だからどこかでcDNAのプラスミドは手に入らないんでしょうか？ 仰る意味は遺伝子合成の方がお安い、と受け止めましたが、プラスミドを 購入して、PCRでいろいろな領域を作って、レティキュロサイトで翻訳を かけてみるとか。 コンピューターで予測しても、いずれ実験データとしてタンパク質そのも のの特性データが必要なので、とりあえずいくつか作っておくのがいいと 思います。 真核生物ですよね？

(無題) 削除/引用 No.3372-4 - 2014/09/13 (土) 00:40:51 - AA どこかでそういうHow to本を見た気もしますが、ちょっと思い出せません。 ロシュかタカラか何かのプロトコル本だったような気もします。 で、EnsembleでmRNA配列が出せたならNCBIのデータベースでCDS配列も探せると思います。 あとはそのCDS配列をWordにコピーして、前と後から20〜30塩基くらいを適当に選べば良いのではないでしょうか？ 相補鎖にするのが手作業になる以外は大した手間では無いと思います。

(無題) 削除/引用 No.3372-3 - 2014/09/12 (金) 23:45:45 - おお というか、自作自演みたいじゃないか、、、

(無題) 削除/引用 No.3372-2 - 2014/09/12 (金) 23:23:16 - おお CDS全長という意味でしょうか。mRNAのUTRもふくめた全長でしょうか。クローニングの目的はなんですか?強制発現ですか?また全長mRNAの振る舞いがみたいのですか。強制発現するとして、tagをつけるつもりですか。 ATGはメチオニンをコードしてますが、開始コドンの役割もします。 なにか基礎的な知識が得られるものを読まれることをおすすめします。あとそう言うところから丁寧にかかれているプロとコール的な本があるならそう言うのがいいかと思いますが、わたしはそう言うのがあるかどうかわかりません。もしかしたらほかの方がしってるかもしれませんね。

プライマー設計について 削除/引用 No.3372-1 - 2014/09/12 (金) 21:00:02 - おお ある遺伝子Xからプライマーを設計して、遺伝子クローニングを行おうと思っています。 Ensembleで遺伝子Xを、cDNAにしたところ塩基配列の長さが1000bp程度となったため、全長使ってプライマーを作成しようと思っています。(そちらの方がお得なので)　ApEなどのソフトウェアを使用せずに、プライマーを全長分作成する方法を教えて頂きたいです。色々調べていく中で、ATGがヒントになっているのではないかと思っておりますが、詳細な事が分かりません。また、それ以外の事でもなにか手がかりとなることがありましたら、どうぞよろしくお願いします。

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