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(無題) 削除/引用 No.3358-6 - 2014/09/19 (金) 23:56:37 - SM 皆様 貴重なご意見ありがとうございました。 なかなかレスできず本当に申し訳ありません。 9月は書類作業が多くて思うように実験ができず進展なしです。 科研費申請までにデータを出したかったのですが、現状難しそうです。 皆様のご意見をまとめさせていただくと、どこに出してもある程度の結果は得られるということでよろしいのでしょうか。 ご意見をいただいておきながらこのような考えで大変恐縮なのですが、各社のウェブサイトを見ても大きな差があるようには思えませんでした。 価格を公表している会社は少ないのですが、Affymetrixだと大体10万円/サンプルという感じでしょうか。 認定プロバイダーというものの存在も今まで知りませんでした。 RNAseqという選択肢も含め、うちに出入りしている業者さんにお勧めを聞いてみることにします。 皆様本当にありがとうございました。 トピは継続しておりますので、以降、お気づきの点などございましたら、再度ご教示頂けますと幸いです。 皆様どうぞよろしくお願いいたします。

(無題) 削除/引用 No.3358-5 - 2014/09/17 (水) 16:35:40 - MK こないだ初めてのマイクロアレイをクラ●ウに頼みましたが、特に問題ありませんでした。(私は業者ではありません) ただ、世の流れから私なら次はRNA seqにしようかと考えてます。

(無題) 削除/引用 No.3358-4 - 2014/09/11 (木) 17:48:02 - PD 代理店によっては扱っていない受託会社もあるので、代理店の営業に聞くのが手っ取り早いです。 概ねAPさんのおっしゃる通りだと思います。 サンプル数によってはかなり価格に差が出る印象です。 アジレントの場合、1枚のスライドに8アレイ乗ってるので、検体数が8だとかなり安くなります。 うちの研究室では以前バイオマトリクスに委託した際、納期が予想より短かったみたいで教授が満足してました。

(無題) 削除/引用 No.3358-3 - 2014/09/09 (火) 01:28:33 - AA チップの値段はどこもそれほど変わらないので、 あとはRNAの品質チェックの有無や増幅ステップの回数あたりで 値段に差が出ますね。 アジレントのチップなど、1チップに複数サンプル乗る場合は サンプル数次第でも変化します。 あとはデータ解析の方も結構かかります。 自前でインフォマができるなら関係ないかもしれませんが。。。

(無題) 削除/引用 No.3358-2 - 2014/09/08 (月) 22:38:49 - AP アフィもアジも、要求する品質を保証できることが担保された業者を認定プロバイダにしているので、どこに依頼しても結果が変わることはないはずです。もしそれによってデータの品質が変わるようなら、プロバイダの責任ではなく、それをプロバイダと認可したアフィ、アジの責任とになるのですから。 間に入るディーラの仕切り値や、キャンペインでお得なところを選べばいいと思います。

マイクロアレイの外注について 削除/引用 No.3358-1 - 2014/09/08 (月) 21:34:08 - SM ヒト培養細胞系でノックダウン実験をしています。 最近、予算に都合がついたのでマイクロアレイ解析を検討しています。 素人が一から試薬を購入して実験するよりも外注に出した方が結果的に早いと思い委託先を検討しています。 数年前よりもかなり安くなった印象がありますが、まだまだ高いため業者選びには失敗したくありません。 Googleで検索するとタカラやバイオマトリックス、DNAチップなどが上位にヒットしますが、この数年以内にマイクロアレイを外注に出された方はいらっしゃいますか？ お勧めなどがあればご教示いただけると幸いです。 なお、スクリーニングが目的で、アレイのメーカーはAffymetrixもしくはAgilentでメジャーに使われているものを検討しています。 よろしくおねがいします。

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