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リアルタイムPCR相対定量
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No.3202-TOPIC - 2014/07/08 (火) 16:22:45 - たか
いつも大変お世話になっております。
リアルタイムPCR相対定量について教えてください。
培養細胞に添加物を加えて、mRNA量の比較を行いたいと思います。
1.ddCt法で相対定量を行いたいと考えていますが、ハウスキーピング遺伝子をいくつかgeNormなどで絞ったとします。この時、上位3位ぐらいまで使用している論文を見ましたが、一つではダメなのでしょうか?
2.3つほど使う場合、A,B,Cの内因性コントロールそれぞれに対しての比率を見て良いものを選ぶのか、それとも平均をとったりするのでしょうか?
ご回答よろしくお願いいたします。
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No.3202-3 - 2014/07/16 (水) 15:01:56 - たか
返信が遅くなり申し訳ございません。
おっしゃることごもっともだと思います。
あまり細かいことに気を取られず、やってみれば良いんだと感じました。
ありがとうございました。
(無題)
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No.3202-2 - 2014/07/13 (日) 14:52:22 - ハーミットパープル
私が思うに、どの方法でもいいと思います。
ある方法で有意差が出て、別の方法では出てこないような場合、その程度の微妙な、偶然出たかもしれない程度の差を根拠にいろいろ推論・結論してもナンセンスなので、仰っている点で悩む必要はないと思います。
逆に、どんな方法でも明瞭に差が出るのであれば、それはそれで、悩む必要はないかと。
リアルタイムPCR相対定量
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No.3202-1 - 2014/07/08 (火) 16:22:45 - たか
いつも大変お世話になっております。
リアルタイムPCR相対定量について教えてください。
培養細胞に添加物を加えて、mRNA量の比較を行いたいと思います。
1.ddCt法で相対定量を行いたいと考えていますが、ハウスキーピング遺伝子をいくつかgeNormなどで絞ったとします。この時、上位3位ぐらいまで使用している論文を見ましたが、一つではダメなのでしょうか?
2.3つほど使う場合、A,B,Cの内因性コントロールそれぞれに対しての比率を見て良いものを選ぶのか、それとも平均をとったりするのでしょうか?
ご回答よろしくお願いいたします。
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