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アガロース電気泳動について トピック削除
No.3156-TOPIC - 2014/06/25 (水) 22:25:39 - バイ男
いつもお世話になっております。
電気泳動像の悩みについて、ご質問させてください。

アガロースゲルの電気泳動時に、私の研究室ではTBEとGel-redを使用しておりますが、サイズが不明になるくらいバンドがスマイリングしてしまいます(サイズマーカーはハシゴのように連結した泳動像になってしまいます)。

現在使用しているのは以下の通りです。
アガロース:TAKARA L03
泳動液:TBE
染色試薬:Gel-red
アガロースを別のものに変えるか、TBEをTAEに変えるか、染色試薬をEtBrやSyberGreenを試してみるか、等を考えていますが、アドバイスいただけないでしょうか?(EtBrはあまり使いたくありませんが…)
 
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(無題) 削除/引用
No.3156-5 - 2014/06/26 (木) 10:34:34 - AP
供給元のFAQの第一番にでてますね。
http://biotium.com/support/faqs/faq-gelred-and-gelgreen-nucleic-acid-gel-stains/

(無題) 削除/引用
No.3156-4 - 2014/06/26 (木) 07:54:19 - 赤
Gel Redを終濃度1Xではなく0.1X位まで薄めると改善した経験があります。

(無題) 削除/引用
No.3156-3 - 2014/06/26 (木) 02:39:11 - おお
gel-redはどの段階で入れてるのでしょうか。
たまにそう言う風になってしまうことはありますが、いつもそうなりますか?

voltageを下げるとかで解決しませんか?

TBEは1xですか0.5xですか。

ゲルの濃度を若干低めにするとどうですか。

ゲルをつくったときのバッファーとえいどうそうのバッファーが微妙に違ったりして(作ったバッチとか保存方法とかで)ませんか。そういうばあいならゲルをせっとしてしばらくおいておくといいかもしれません。あるいは低電圧でプレランするか。

(無題) 削除/引用
No.3156-2 - 2014/06/26 (木) 00:55:17 - ~
その現象はラボ全体で起きているのでしょうか?
ラボとしてその条件を使っているというのと、サイズが分からないほどのスマイリングが起きているのとは、話が噛み合わないように見えますが。

バイ男さんだけサンプルの塩濃度が高いとか、アガロースをミリQ水で作ってるとか、
何か書いていない部分に問題がありませんか?

アガロース電気泳動について 削除/引用
No.3156-1 - 2014/06/25 (水) 22:25:39 - バイ男
いつもお世話になっております。
電気泳動像の悩みについて、ご質問させてください。

アガロースゲルの電気泳動時に、私の研究室ではTBEとGel-redを使用しておりますが、サイズが不明になるくらいバンドがスマイリングしてしまいます(サイズマーカーはハシゴのように連結した泳動像になってしまいます)。

現在使用しているのは以下の通りです。
アガロース:TAKARA L03
泳動液:TBE
染色試薬:Gel-red
アガロースを別のものに変えるか、TBEをTAEに変えるか、染色試薬をEtBrやSyberGreenを試してみるか、等を考えていますが、アドバイスいただけないでしょうか?(EtBrはあまり使いたくありませんが…)

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