Bio Technical フォーラム

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RNAlaterについて トピック削除
No.3132-TOPIC - 2014/06/17 (火) 08:42:13 - しんじ
実験素人ですが、よろしくお願いします。
凍結切片からレーザーマイクロダイジェスチョン(LCM)を行い、RT-PCRを行う予定です。
LCMで採取できた組織はRNAlaterで保存することは可能でしょうか。
もし可能であれば、新鮮組織用のRNAlaterを用いるべきなのか、凍結組織用のRNAlaterを用いるべきなのか教えていただけますでしょくか。
 
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(無題) 削除/引用
No.3132-5 - 2014/06/17 (火) 23:06:25 - しんじ
みなさまありがとうございます。
LCMを行う施設が、私のラボから少し距離があるため少しでもRNAの分解が抑えられればと思いご相談させていただきました。

皆様のご意見参考にさせていただきます。

(無題) 削除/引用
No.3132-4 - 2014/06/17 (火) 14:14:31 - AA
RNLaterに直接回収して、そのまま−80℃で数週間は安定だと、
Leicaの技術のヒトに言われたことがあります。

次の精製のステップがRNeasyみたいなカラムであれば、
RNlaterで保存しておくのが良いのではないでしょうか?

RNAlaterでなければだめですか? 削除/引用
No.3132-3 - 2014/06/17 (火) 13:44:15 - ema
目的が
>凍結切片からレーザーマイクロダイジェスチョン(LCM)を行い、RT-PCRを行う予定です。
ならRNAlaterでなくRNA回収用のPhenol系のIsogen等、もしくはカラムキットのLusisBufferに直接入れて-80℃凍結ではだめなのでしょうか?
切片になって十分に薄いので試薬の浸透も十分でRNAが壊れるならその前の処理での可能性が大きいような。
RNAlaterステップををかませると後でWashしないと塩があり過ぎとか、Wash工程でサンプル少量なのでロスしても見えないし怖いので。

(無題) 削除/引用
No.3132-2 - 2014/06/17 (火) 12:58:04 - bluehornet
LCMは行ったことがないので参考になるかはわかりませんが・・・。

RNAlaterもRNAlater-iceも、組織から脱水する事によってRNaseを働かなくすることが目的の試薬です。MSDSを見ればわかりますが、RNAlaterの主成分は硫酸アンモニウムで、濃度が高く比重も高くなっています。RNAlater-iceは主成分がエタノールでそれほど比重も高くありません。

LCMで採取した組織ということでかなり小さいでしょうから、RNAlaterでもRNAlater-iceでも瞬時に脱水されると思います。ですがRNAlaterだと後で遠心分離等を行うときに比重が高く扱いにくいと思うので、RNAlater-iceの方が適してるんじゃないでしょうか?

便乗質問で申し訳ありませんが、どなたかRNAlater-iceと同等な試薬を自作した人がいましたらレシピ等教えてもらえないでしょうか?
エタノール、DMSO、適当なバッファーを混ぜれば作れそうな気がするのですが・・・。

RNAlaterについて 削除/引用
No.3132-1 - 2014/06/17 (火) 08:42:13 - しんじ
実験素人ですが、よろしくお願いします。
凍結切片からレーザーマイクロダイジェスチョン(LCM)を行い、RT-PCRを行う予定です。
LCMで採取できた組織はRNAlaterで保存することは可能でしょうか。
もし可能であれば、新鮮組織用のRNAlaterを用いるべきなのか、凍結組織用のRNAlaterを用いるべきなのか教えていただけますでしょくか。

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