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フローサイトメトリーのフリーまたは安価なソフト トピック削除
No.3086-TOPIC - 2014/05/29 (木) 22:04:45 - ひろ
よろしくお願いします。

私は、フローサイトメーターを使った事が無い者です。

あるGPCRに対する抗体を開発し、その抗体の開発や、その抗体を用いて得られた興味深い現象について論文投稿しました。その結果、好意的に受け止めてもらえたようなのですが、ある審査員から、フローサイトメーターを使い、処理Xに対する培養細胞の膜上の当該GPCRの量の変化を調べよ、というデータ追加の指示を受けました。

つまり、処置群と対照群の膜上GPCR量の比較さえ出来ればよいのです。

当方の大学の共同施設には、フローサイトメーターがあり、測定は実施できます。また使用説明会には参加していたので、測定などはなんとかなると考えています。

しかし得られたデータを解析するためのソフトにはどのようなものがあるのか全く知りません。特に、次の2条件を満たすソフトを探しています。

(1)初心者でも使いやすいソフト。使用方法が判りやすいマニュアル、または日本語での使用説明をしたウェブのあるソフト。

(2)予算の理由でフリーウェアか、せいぜい10万円未満で複数年使えるソフト。

どうもFlowJoが有名らしいですが、高すぎます。
/www.digital-biology.co.jp/allianced/products/flowjo/

ネット上の別掲示板での2008年ぐらいのやりとりから、WinMDI というフリーウェアが見つかりましたが、古いソフトらしくて、2008年ぐらいで既に動作が不安定だったようです。

どなたか、よいソフトの御紹介をお願いします。
 
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(無題) 削除/引用
No.3086-5 - 2014/05/31 (土) 12:54:52 - mbb
私はFlowing Softwareというのを使っています。
フリーウェアです。
http://www.flowingsoftware.com/

使い方はオンラインのビデオで教えてくれてるので
英語が不得意でもなんとかわかるのではないかと
思います。
ただ、Flowjoに比べたら断然使い勝手や見栄えは
悪いです。

なぜ使っているのかというと、フローサイトメータが
共通機器で普段施錠されているため自由に使えない上、
使用時間で課金されるので、データを持ち帰ってから
おちついて解析するためです。
各施設によって事情があるものです。

(無題) 削除/引用
No.3086-4 - 2014/05/30 (金) 16:19:11 - alpha
ふつう、フローサイトに解析ソフトって付属してませんか?
それが当たり前なのかと思っていました。。。

(無題) 削除/引用
No.3086-3 - 2014/05/30 (金) 07:29:02 - 〜
WinMDIは今でも十分使えますよ。
日本語のマニュアルはないですが。
ていうか測定ができるんであれば、解析も同じソフトでできると思うんだが、、、。

(無題) 削除/引用
No.3086-2 - 2014/05/30 (金) 05:38:44 - モモ
FlowJoの無料お試し期間で論文仕上げてしまうのは無理ですか?

フローサイトメトリーのフリーまたは安価なソフト 削除/引用
No.3086-1 - 2014/05/29 (木) 22:04:45 - ひろ
よろしくお願いします。

私は、フローサイトメーターを使った事が無い者です。

あるGPCRに対する抗体を開発し、その抗体の開発や、その抗体を用いて得られた興味深い現象について論文投稿しました。その結果、好意的に受け止めてもらえたようなのですが、ある審査員から、フローサイトメーターを使い、処理Xに対する培養細胞の膜上の当該GPCRの量の変化を調べよ、というデータ追加の指示を受けました。

つまり、処置群と対照群の膜上GPCR量の比較さえ出来ればよいのです。

当方の大学の共同施設には、フローサイトメーターがあり、測定は実施できます。また使用説明会には参加していたので、測定などはなんとかなると考えています。

しかし得られたデータを解析するためのソフトにはどのようなものがあるのか全く知りません。特に、次の2条件を満たすソフトを探しています。

(1)初心者でも使いやすいソフト。使用方法が判りやすいマニュアル、または日本語での使用説明をしたウェブのあるソフト。

(2)予算の理由でフリーウェアか、せいぜい10万円未満で複数年使えるソフト。

どうもFlowJoが有名らしいですが、高すぎます。
/www.digital-biology.co.jp/allianced/products/flowjo/

ネット上の別掲示板での2008年ぐらいのやりとりから、WinMDI というフリーウェアが見つかりましたが、古いソフトらしくて、2008年ぐらいで既に動作が不安定だったようです。

どなたか、よいソフトの御紹介をお願いします。

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