Bio Technical フォーラム

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統計処理 トピック削除
No.3082-TOPIC - 2014/05/29 (木) 11:01:26 - sinnmaimai
いつもお世話になっております。

統計についてまだまだ勉強中で、アドバイスをいただきたく思います。
いつもはt-testを用いて統計処理を行っているのですが、指導員の方にt-testではだめだと意見をいただきました。

解析するのは、ある細胞Aの親株2個と変異型2個に刺激を加えた後の遺伝子bの発現上昇の差です。
親株2個は、刺激後、遺伝子bが上昇するのですが、変異型2個ではこの発現上昇がおこりませんでした。
これを統計処理する場合、どんな方法があるでしょうか?
ひとつひとつの細胞の発現変化をt-testでみていたのですが、そうではなく、親株と変異型で発現変化に有意差があるのか示すべきだと言われました。

本などで統計の勉強もしているので、参考になる文献の情報だけでも、アドバイスいただけたら助かります。
 
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(無題) 削除/引用
No.3082-3 - 2014/05/30 (金) 14:41:52 - mom-a
>2個づつじゃあ検定の計算ができても、検定自体があまり信用できないから

おおさんが↑でおっしゃっているとおりなのですが(最低3個必要という考えの人が多いと思います)。

それはそれとして

>t-testではだめだ

というのは正確にはどう言われたのですか?
というのも、ひとつひとつの細胞の発現変化をみていたのがいけないといわれたから親株と変異株の発現変化をみるということであれば親株と変異株でStudent t-testというのはいいのですか?ということです。

普通はやらないと思いますが、例えば細胞と株の一元配置分散分析というのも方法としてあり得るかもしれませんし
2群の平均値の差の検定でも、パラメトリックなデータと考えてt-testを行うか、ノンパラメトリックなデータと考えてWilcoxon testを行うか2種類の方法があります。

t-testとWilcoxon testの違いについては、本で勉強されているなら本に出ていると思います。お手持ちの本にのっていないようでしたら、この2つの区別は重要ですので、パラメトリック、ノンパラメトリックという単語が出ている本を探して読んで下さい。まずは基本的なものでご自分の読みやすいもの、ただしあまり古くないものを読まれれば良いと思います。

(無題) 削除/引用
No.3082-2 - 2014/05/29 (木) 13:06:51 - おお
2個づつじゃあ検定の計算ができても、検定自体があまり信用できないから、ここの細胞で有意をもってあがる、上がらないなどの検定をしておいて、変異株にWTを発現させたとき形質が回復するとかそう言う実験に持ち込んだ方がよろしいのではないでしょうか。

統計処理 削除/引用
No.3082-1 - 2014/05/29 (木) 11:01:26 - sinnmaimai
いつもお世話になっております。

統計についてまだまだ勉強中で、アドバイスをいただきたく思います。
いつもはt-testを用いて統計処理を行っているのですが、指導員の方にt-testではだめだと意見をいただきました。

解析するのは、ある細胞Aの親株2個と変異型2個に刺激を加えた後の遺伝子bの発現上昇の差です。
親株2個は、刺激後、遺伝子bが上昇するのですが、変異型2個ではこの発現上昇がおこりませんでした。
これを統計処理する場合、どんな方法があるでしょうか?
ひとつひとつの細胞の発現変化をt-testでみていたのですが、そうではなく、親株と変異型で発現変化に有意差があるのか示すべきだと言われました。

本などで統計の勉強もしているので、参考になる文献の情報だけでも、アドバイスいただけたら助かります。

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