Bio Technical フォーラム

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RNAsequenceとMass spectrometry トピック削除
No.2876-TOPIC - 2014/03/07 (金) 12:55:59 - B
いつも参考にさせていただいております。
疾患マーカーの検索のために、患者血液中のmicroRNAをRNAsequence調べるというプロジェクトがあるのですが、microRNA以外にもMass spectrometryなどで蛋白の発現を調べるという方法もあるかと思います。
ざっくりとした質問で恐縮ですが、疾患マーカーを調べる際にはmicroRNAを調べるのと蛋白を調べるのとどちらが理想的なのでしょうか?(ケースバイケースかもしれませんが、どちらが解析し易いなどはあるのでしょうか?)
microRNAをアレイなどで調べた論文などはよく見かけますが、どのような利点があってmicroRNAにfocusしているのでしょうか?
無知な質問で申し訳ありませんが、よろしくお願いいたします。
 
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(無題) 削除/引用
No.2876-3 - 2014/03/07 (金) 14:46:28 - おお
どちらにおいても特異的なものがあれば、あるいは特異的なコンビネーションがあればマーカーといえる。タンパクで特異的といえないのであれば、miRNAをやってもいいし、タンパクとmiRNAのコンビネーションで精度を上げるのもいい。タンパクはかなりマーカー探しとかやられているので、 全体の流れとしてmiRNAとかにシフトしているというのもあるとおもう。とくに血液に放出されているものもあるようなので、採血で見れるマーカーであれば、検査として患者の負担を抑えれるのもそういう流れを手伝っているように思う。マーカーをファンクしょんレベルで機能や現象の理解につなげようというのであれば、両者まったく性質が違うものなので、もう少しいろいろ考えることがあると思う。

(無題) 削除/引用
No.2876-2 - 2014/03/07 (金) 13:09:40 - mm
microRNAとタンパク質では知りたい事が全く異なります。
mRNAとタンパク質なら相関性はありますけど。

RNAsequenceとMass spectrometry 削除/引用
No.2876-1 - 2014/03/07 (金) 12:55:59 - B
いつも参考にさせていただいております。
疾患マーカーの検索のために、患者血液中のmicroRNAをRNAsequence調べるというプロジェクトがあるのですが、microRNA以外にもMass spectrometryなどで蛋白の発現を調べるという方法もあるかと思います。
ざっくりとした質問で恐縮ですが、疾患マーカーを調べる際にはmicroRNAを調べるのと蛋白を調べるのとどちらが理想的なのでしょうか?(ケースバイケースかもしれませんが、どちらが解析し易いなどはあるのでしょうか?)
microRNAをアレイなどで調べた論文などはよく見かけますが、どのような利点があってmicroRNAにfocusしているのでしょうか?
無知な質問で申し訳ありませんが、よろしくお願いいたします。

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