Bio Technical フォーラム

  • バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
  • 新しいテーマで話を始める場合、質問をする場合は「新しいトピックを作る」から書き込みをしてください。
  • 質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
  • このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。

新しいトピックを作る | トピック一覧 | 研究留学ネットに戻る

ひとつ前のフォーラム(readのみ)

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

硫黄によるDNA抽出阻害 トピック削除
No.2849-TOPIC - 2014/02/25 (火) 13:26:08 - TBE48
硫黄によるDNA抽出阻害ってあるのでしょうか?
硫黄性資材についた菌のDNAを抽出しようとしたが、全く抽出できず。

阻害の有無、非阻害にする方法等あれば教えてください!
 
- このトピックにメッセージを投稿する -



11件 ( 1 〜 11 )  前 | 次  1/ 1. /1


(無題) 削除/引用
No.2849-11 - 2014/03/05 (水) 14:33:49 - ああ
後学のため,どう解決されたのかお教え頂けると有り難いのです。

(無題) 解決済み 削除/引用
No.2849-10 - 2014/03/05 (水) 14:09:51 - TBE48
解決しました。

(無題) 削除/引用
No.2849-9 - 2014/02/25 (火) 20:04:21 - Harmonia
「抽出できず」の根拠は?
翻って、何グラムとれる予定がゼロだったのでしょうか?

また、菌は溶菌できましたか?
菌体が固い場合は、乳鉢ですりつぶしてとるなど、物理破壊も必要。

(無題) 削除/引用
No.2849-8 - 2014/02/25 (火) 18:19:22 - seven
阻害の有無はポジティブコントロールサンプルに硫黄性資材を加えてみれば確認はできそうですね。
菌の種類によっては多糖とかでDNA抽出が難しい場合も考えられます。

(無題) 削除/引用
No.2849-7 - 2014/02/25 (火) 17:34:54 - おお
んてか、酸化物も気体だなぁ。

(無題) 削除/引用
No.2849-6 - 2014/02/25 (火) 17:31:21 - おお
酸化物やH2Sなどが多く含まれているなら、溶液のpHに影響するかもしれませんね。ただH2Sは確か気体なのでなんらかの形で吸収されていなければすぐ抜けてなくなっているかもしれませんが(というかそう言う有毒なものを扱っているのかどうか。。。)。

(無題) 削除/引用
No.2849-5 - 2014/02/25 (火) 16:38:11 - mon
先ほどの文献のNaI 溶液には硫酸ナトリウムが含まれているから、硫酸イオンはガラスビーズへの結合を阻害しないようです。失礼しました。

(無題) 削除/引用
No.2849-4 - 2014/02/25 (火) 16:31:06 - mon
ガラスビーズに吸着させる方法で、TBE bufferで泳動したゲルからの抽出法が参考になるかも。
ホウ酸も吸着を阻害するので。
例えば、コレ。
http://bishoplab.bsd.uchicago.edu/protocols/GlassMilk.pdf

(無題) 削除/引用
No.2849-3 - 2014/02/25 (火) 16:25:43 - mon
硫黄というか硫酸基はリン酸基と似ているから、レジンなどへの吸着は阻害しそうですけど。
どのような抽出法を使ったのか示さないと、回答がないと思いますよ。

(無題) 削除/引用
No.2849-2 - 2014/02/25 (火) 16:15:34 - おお
これをきいたからといって答えられると限りませんが、硫黄資材ですっけ、そこからDNA抽出溶液にこんたみしてくるとおもわれる分子はなんですか?硫黄そのものですか?S--イオンとかでしょうか。それとも酸化物でしょうか、不溶性硫化物でしょうか。

DNA抽出方法は具体的にどのようなほうほうでしょうか。

このような情報があったほうがsuggestionが得られやすいかなぁと思いました。

硫黄によるDNA抽出阻害 削除/引用
No.2849-1 - 2014/02/25 (火) 13:26:08 - TBE48
硫黄によるDNA抽出阻害ってあるのでしょうか?
硫黄性資材についた菌のDNAを抽出しようとしたが、全く抽出できず。

阻害の有無、非阻害にする方法等あれば教えてください!

11件 ( 1 〜 11 )  前 | 次  1/ 1. /1


パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する
名前 
メール   アドレス非公開
   タイトル 
本文      
設定  クッキーを保存(次回の入力の手間を省けます)
上に上げない(トピックの一覧で一番上に移動させません)
解決(問題が解決した際にチェックしてください)
暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。
送信 

〔使い方〕
  • 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。
  • 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。
  • 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。