Bio Technical フォーラム

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シークエンス結果の解析 トピック削除
No.2807-TOPIC - 2014/02/07 (金) 15:55:45 - レーン
これまでシークエンス結果の解析は古いマックでDNasisを使っていたのですが、そろそろWin用のソフトに乗り換えようかと思っています。
サブクローニングして、そのうちいくつかをシークエンスして、どのクローンが正しいかを調べるのが主な使い方なのですが、よいソフトはございませんでしょうか?
Win用のDNasisProは販売中止になっているとのことで、他を探しております。
支払いの関係でDNADynamoも候補から外しております。

予算は20万以下くらいを考えております。
フリーソフトでも構いません(というか、むしろ望ましいです)
よろしくお願いいたします。
 
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No.2807-5 - 2014/02/07 (金) 20:20:31 - Harmonia
ぼくはたいていのことは
http://emboss.toulouse.inra.fr/

2配列比較なら、その中の est2genome。

(無題) 削除/引用
No.2807-4 - 2014/02/07 (金) 16:57:18 - レーン
>cDNAさん

ApEさっそくDLしてみました。
非常に使いやすいです!
ありがとうございました。

>おおさん

どうもBLASTでやるのが手間でして・・・。
レスありがとうございました!

(無題) 削除/引用
No.2807-3 - 2014/02/07 (金) 16:34:42 - おお
波形を見るのはABIのフリーのやつ使ってます(WIN)。それとテキストのデーターをまあぞくにいうと制限酵素認識配列を探せるたぐいのソフトで読むぐらいですが、これも複数フリーなものがでまわってますが、、、
解析って何やるんですか?

あ、配列確認ですよね。テキストのデーターはweb上のblastとかでもいいんじゃないでしょうか。

(無題) 削除/引用
No.2807-2 - 2014/02/07 (金) 16:17:06 - cDNA
波形の表示にはABIからダウンロードできるSequence Scannerを使って、配列の比較等にはApeを使っていますが、悪くないと思います。

シークエンス結果の解析 削除/引用
No.2807-1 - 2014/02/07 (金) 15:55:45 - レーン
これまでシークエンス結果の解析は古いマックでDNasisを使っていたのですが、そろそろWin用のソフトに乗り換えようかと思っています。
サブクローニングして、そのうちいくつかをシークエンスして、どのクローンが正しいかを調べるのが主な使い方なのですが、よいソフトはございませんでしょうか?
Win用のDNasisProは販売中止になっているとのことで、他を探しております。
支払いの関係でDNADynamoも候補から外しております。

予算は20万以下くらいを考えております。
フリーソフトでも構いません(というか、むしろ望ましいです)
よろしくお願いいたします。

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