Bio Technical フォーラム

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プロモータの調べ方。 トピック削除
No.2789-TOPIC - 2014/01/31 (金) 17:56:21 - 初心者
研究を始めて、まもない学生ですので、いたらない天もあると思いますが、ご教授お願いしたいことがあり、書き込ませていただきました。

現在、研究室で、あるノックアウトマウスを作成したのですが、E.7.5のあたりで胎生致死なることが分かりました。

そこで、この時期に重要な役割を果たしている遺伝子のプロモーターを用いたトランスジェニックをかけることで、レスキューできるかの検討を考えているのですが、そのプロモーターのあたりをつける方法がわかりません。
また、そういったものを検索できるデーターベースが存在するなら、お教えいただきたいです。

よろしくお願い致します。
 
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(無題) 削除/引用
No.2789-6 - 2014/02/01 (土) 14:19:13 - おお
そうですねぇ。わたしもHarmoniaさんのように思ったのですが目的がよくわからないですから。。。潰したところにノックインしたらとまで書こうかと思ったりも、、、でもそれじゃあ元(WT)に戻してるっていうのとあまり変わらないわけで、、、そう言うふうに戻してartifactかどうかを否定するのならわかるけど、、、ちょっとそれも、、、

あとわざとE7.5にこだわっててその時点だけの発現を考えているならオリジナルのプロモーターだと目的がたっせいされるのだろうかとか。。。

(無題) 削除/引用
No.2789-5 - 2014/02/01 (土) 08:47:56 - Harmonia
その時期に(その組織で)発現する遺伝子のプロモーターでその遺伝子を発現して
レスキューして何がしたいのですか?
ご希望のプロモーターにぴったりのものは、ノックアウトした遺伝子のものです。
それに蛋白質コード領域をつないだものを作って入れるなら、その遺伝子を
ふくむBACクローンを入れてもいいのかなと思います。
しかし、それでレスキューできないと困りますね。
それだけのことがしたいのでしょうか?
それとも、その遺伝子の下流因子を発現させる?
それなら意味あるかも。

(無題) 削除/引用
No.2789-4 - 2014/02/01 (土) 06:10:01 - おお
http://www.nature.com/nrm/journal/v10/n2/fig_tab/nrm2618_F3.html
さあねぇ。。。

その時期に誘導する方がいいかもね薬剤誘導性プロモーターとかつかって。

(無題) 削除/引用
No.2789-3 - 2014/01/31 (金) 23:02:57 - 独り言
ユビキタスなCAGプロモーターではだめなのですか?なぜE7.5からに限定する必要があるのですか?E7.5から発現するプロモーターがあっても、その目的の組織で発現するかもわからないかもしれないし。そこまでこだわるなら内在性のその遺伝子のプロモーターを使った方がましなのでは。

ここはどう? 削除/引用
No.2789-2 - 2014/01/31 (金) 18:58:04 - KIO
http://promoter.cdb.riken.jp/

Googleでpromoter databaseで検索しただけですが…

プロモータの調べ方。 削除/引用
No.2789-1 - 2014/01/31 (金) 17:56:21 - 初心者
研究を始めて、まもない学生ですので、いたらない天もあると思いますが、ご教授お願いしたいことがあり、書き込ませていただきました。

現在、研究室で、あるノックアウトマウスを作成したのですが、E.7.5のあたりで胎生致死なることが分かりました。

そこで、この時期に重要な役割を果たしている遺伝子のプロモーターを用いたトランスジェニックをかけることで、レスキューできるかの検討を考えているのですが、そのプロモーターのあたりをつける方法がわかりません。
また、そういったものを検索できるデーターベースが存在するなら、お教えいただきたいです。

よろしくお願い致します。

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