Bio Technical フォーラム

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Terminal transferaseが付加する塩基長はどれくらいか トピック削除
No.2723-TOPIC - 2014/01/11 (土) 09:36:17 - トム
この度実験でTerminal transferaseを用いることになり疑問がわきましたので質問させて頂きます。

cDNAにTerminal transferaseとdATP を作用させ、3末端にオリゴAを付加させようと考えております。その後oligoTを持つprimerにより増幅を行う予定です。

私の疑問はTerminal transferaseがどの程度Aを末端に付加できるのかということです。論文によってはPrimer側のOligoTが20b近いものもあります。20b近く伸びるという認識で良いのでしょうか。

今回dGTPを作用させる実験も考えております。OligoGが余りにも伸長するとPCR反応が上手くいかなくなるかなと心配しています。

どなたかTerminal transferaseを実験で用いている方がおりましたらご教授頂けると有難いです。
 
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(無題) 削除/引用
No.2723-3 - 2014/01/11 (土) 12:00:22 - トム
中年様

貴重な情報有難うございます。
かなり伸長するのですね。
条件検討を色々としてみたいと思います。

(無題) 削除/引用
No.2723-2 - 2014/01/11 (土) 11:11:16 - 中年
もちろん条件によりけりですが、私が以前に分与を受けた大昔のcDNAは100bp位のtailが付いていました。

このマニュアルの条件だと、100-130dAが付加されるとありますね。
http://www.thermoscientificbio.com/uploadedFiles/Resources/EP016_TS_8.pdf

Terminal transferaseが付加する塩基長はどれくらいか 削除/引用
No.2723-1 - 2014/01/11 (土) 09:36:17 - トム
この度実験でTerminal transferaseを用いることになり疑問がわきましたので質問させて頂きます。

cDNAにTerminal transferaseとdATP を作用させ、3末端にオリゴAを付加させようと考えております。その後oligoTを持つprimerにより増幅を行う予定です。

私の疑問はTerminal transferaseがどの程度Aを末端に付加できるのかということです。論文によってはPrimer側のOligoTが20b近いものもあります。20b近く伸びるという認識で良いのでしょうか。

今回dGTPを作用させる実験も考えております。OligoGが余りにも伸長するとPCR反応が上手くいかなくなるかなと心配しています。

どなたかTerminal transferaseを実験で用いている方がおりましたらご教授頂けると有難いです。

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