アレイはDNAでしょうか、RNAでしょうか、μRNAでしょうか。たぶんRNAと仮定して
表面抗原で染色できセルソーターで生きたまま細胞を分けることができるならそちらのほうが好ましいと思います。(ソート時間が長いし大変だとは思いますが)
MACS等でソート前のエンリッチはソート時間の短縮とか便利なのですが、作業ステップが増えるとロスが多くなり最終的に得られる細胞数が減ると思います。
ダイセクションは(組織固定→組織切片;ないかも)はがれないようにスライドへの固定・染色(染色も核染色で単色の短い時間ならともかく、抗体染色で2次抗体までかけると水系;RNAaseが働き易いです;作業時間が長くなる)等でRNAの分解が進み、RT-PCRならともかく既存のアレイにはお勧めしません。
*分解したRNAで検出試薬もあります。が、通常の試薬で標識した結果とすこし異なるので、比較解析は気をつけないといけないと思います。 |
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